竹中 要一タケナカ ヨウイチ |
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所属学部・学科等
- 総合情報学部 総合情報学科
職名 (資格)
- 教授 2017年 4月 1日
出身学校・専攻
- 大阪大学 基礎工学部情報工学科 1995年 飛び級
出身大学院・研究科
- 大阪大学博士課程 基礎工学研究科物理系 1997年 修了
- 大阪大学博士課程 基礎工学研究科情報数理系 2000年 修了
取得学位
- 修士(工学) 1997年 3月 大阪大学
- 博士(工学) 2000年 3月 大阪大学
ホームページ・メール
専門分野
専門分野 | キーワード |
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情報科学 | |
ゲノム情報科学 | |
図書館情報学・人文社会情報学 |
研究課題
現在の研究課題名 | 奨励研究(A)「幾何構造を利用したクラスタリングによるcDNAの組織別発現パターン解析」 |
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研究態様 | |
研究期間 | 2001年 ~ 2003年 |
研究制度 | 科学研究費補助金 |
キーワード | |
研究分野 | |
研究テーマ概要 |
現在の研究課題名 | 若手研究(B)「相互情報量に基づいた遺伝子配列アライメントの高速化手法に関する研究」 |
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研究態様 | |
研究期間 | 2003年 ~ 2006年 |
研究制度 | 科学研究費補助金 |
キーワード | |
研究分野 | |
研究テーマ概要 |
現在の研究課題名 | 若手研究(B)「CAGE絶対値遺伝子発現プロファイルによるヒトとマウスの組織特異性の網羅的解析」 |
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研究態様 | |
研究期間 | 2007年 ~ 2010年 |
研究制度 | 科学研究費補助金 |
キーワード | |
研究分野 | |
研究テーマ概要 |
現在の研究課題名 | 基盤研究(C)「例規条項の自治体間対応関係と差異の網羅的な自動抽出−道州制への円滑な移行に向けて」 |
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研究態様 | |
研究期間 | 2009年 ~ 2013年 |
研究制度 | 科学研究費補助金 |
キーワード | |
研究分野 | |
研究テーマ概要 |
現在の研究課題名 | 基盤研究(B)「細胞分化課程の解明のための遺伝子ネットワーク解析技術の開発」 |
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研究態様 | |
研究期間 | 2010年 ~ 2013年 |
研究制度 | 科学研究費補助金 |
キーワード | |
研究分野 | |
研究テーマ概要 |
現在の研究課題名 | 若手研究(A) 「次世代シークエンサーを用いた対立染色体配列の決定と発現解析法の精度向上」 |
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研究態様 | |
研究期間 | 2010年 ~ 2013年 |
研究制度 | 科学研究費補助金 |
キーワード | |
研究分野 | |
研究テーマ概要 |
現在の研究課題名 | 挑戦的萌芽研究「完全線形符号に基づくDNAの符号化によるゲノムマッピングの高速化」 |
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研究態様 | |
研究期間 | 2012年 ~ 2015年 |
研究制度 | 科学研究費補助金 |
キーワード | |
研究分野 | |
研究テーマ概要 |
現在の研究課題名 | 基盤研究(C)「インタラクティブな大規模ベイジアンネットワーク推定法の提案と生物学データの応用」 |
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研究態様 | |
研究期間 | 2015年 ~ 2018年 |
研究制度 | 科学研究費補助金 |
キーワード | |
研究分野 | |
研究テーマ概要 |
現在の研究課題名 | 基盤研究(B)「病態不一致の双生児を対象とした,生活習慣病の病態に及ぼす環境要因の厳密な解明」 |
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研究態様 | |
研究期間 | 2016年 ~ 2019年 |
研究制度 | 科学研究費補助金 |
キーワード | |
研究分野 | |
研究テーマ概要 |
現在の研究課題名 | 「提案するDNA beads 計算機の実現」((財) 大阪大学後援会研究助成) |
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研究態様 | |
研究期間 | 2001年 ~ 2002年 |
研究制度 | |
キーワード | |
研究分野 | |
研究テーマ概要 |
研究職歴
- マッキンゼー&カンパニー 1995年3月 13日~1995年3月 17日
- 北斗会看護専門学校非常勤講師 統計学 1997年4月 1日~2000年3月 31日
- 日本学術振興会特別研究員 1998年4月 1日~2000年3月 31日
- 大阪大学助手 大学院基礎工学研究科 2000年4月 1日~2002年3月 31日
- 大阪大学助教授 大学院情報科学研究科 2002年4月 1日~2007年3月 31日
- 大阪大学准教授 大学院情報科学研究科 2007年4月 1日~2017年3月 31日
- 大阪大学准教授 大学院医学系研究科附属ツインリサーチセンター(兼任) 2014年4月 1日~2017年3月 31日
- 関西大学教授 総合情報学部 2017年4月 1日
- 大阪大学 大学院医学系研究科 招へい教授 2017年4月 1日
- 大阪大学 大学院情報科学研究科 招へい教授 2017年4月 1日~2019年3月 31日
受賞・学術賞
- 猪瀬学術奨励賞 1996年 9月 (電気・電子情報学術振興財団)
- FIT2004論文賞 2004年 9月 8日 (情報科学技術フォーラム推進委員会)
- Best Poster Award 2010年 12月 9日 (国際会議GIW 2010)
- Best Paper Award 2012年 1月 19日 (国際会議APBC 2012)
- 総長奨励賞(研究部門) 2012年 8月 1日 (大阪大学)
- 総長奨励賞(研究部門) 2013年 8月 2日 (大阪大学)
- Outstanding Paper Award 2014年 6月 4日 (Information Processing Society of Japan)
所属学会
所属学会・団体名 | 役職名 (役職在任期間) |
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情報処理学会 | 論文ジャーナル誌編集委員(2010年4月 ~2014年3月 ), Transactions on Bioinformatics 編集委員(2006年4月 ), Transactions on Bioinformatics 編集副委員長(2009年4月 ~2014年3月 ), Transactions on Bioinformatics 編集委員長(2015年4月 ), バイオ情報学研究会運営委員(2005年6月 ), バイオ情報学研究会幹事(2009年4月 ~2011年3月 ) |
電子情報通信学会 | |
日本バイオインフォマティクス学会 | |
言語処理学会 | |
IEEE | |
情報ネットワーク法学会 |
研究業績
No. | 研究業績の種類 | 発表年月日 | 標題 | 出版物の種類 | 共著・単著の別 | 出版社・掲載誌 | 巻・号・頁 |
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1 | 学会発表7 | 2022年9月 13日~2022年9月 13日2022,09,13,2022,09,13 | Quantify the Effect of Genetic Factors on DNA Methylation using Identical Twins | その他 | 共著 | proceedings of IIBMP2022 | O1-3 |
2 | 国際学会8 | 2021年11月 14日~2021年11月 15日2021,11,14,2021,11,15 | The legislative study on Meiji civil code by machine learning | その他 | 共著 | Proceedings of Fifteenth International Workshop on Juris-informatics (JURISIN 2021) | |
3 | 国際学会8 | 2021年7月 7日~2021年7月 9日2021,07,07,2021,07,09 | Rotational weight update in full-connection layers exceeds dropout in image recognition tasks | 学術雑誌 | 共著 | Proceedings of 2nd International Conference on Deep Learning Theory and Applications | |
4 | 講演19 | 2020年11月 26日~2020年11月 26日2020,11,26,2020,11,26 | 計算機による法条文の自然言語解析 | その他 | 共著 | ||
5 | 学会発表7 | 2020年11月 26日~2020年11月 26日2020,11,26,2020,11,26 | CNNの画像分類タスクにおけるRotational-Updateの検証 | その他 | 国内共著 | 第23回情報論的学術理論ワークショップ(IBIS2020) | 発表番号21 |
6 | 学会発表7 | 2020年9月 1日~2020年9月 1日2020,09,01,2020,09,01 | 深層学習の逆伝播における全結合層ニューロンの準同期式更新 | 学術雑誌 | 共著 | FIT2020 第19回情報科学技術フォーラム講演論文集 | CG-003 |
7 | 講演19 | 2020年8月 22日~2020年8月 22日2020,08,22,2020,08,22 | 機械学習による明治民法と参照立法例の関係分析 | ||||
8 | 学会発表7 | 2020年3月 18日~2020年3月 18日2020,03,18,2020,03,18 | 分散ベクトルに基づく文書のアライメント -AKB48の歌詞の類似性解析- | 学術雑誌 | 単著 | 言語処理学会第26回大会予稿集 | D3-1 |
9 | 学会発表7 | 2020年3月 17日~2020年3月 17日2020,03,17,2020,03,17 | 地方議会議事録にもとづく議会発言特徴の抽出 | 学術雑誌 | 共著 | 言語処理学会第27回年次大会予稿集 | P-1-9 |
10 | 学会発表7 | 2020年3月 17日~2020年3月 17日2020,03,17,2020,03,17 | 明治民法と各国民法との条文類似関係にもとづく立脚点の解析 | その他 | 共著 | 言語処理学会第27回年次大会予稿集 | P-1-24 |
11 | 学会発表7 | 2019年11月 20日~2019年11月 20日2019,11,20,2019,11,20 | 情報論的学習理論ワークショップ | その他 | 共著 | 2Q3-J-2-05 | |
12 | 論文1 | 2019年10月 ~2019年10月 2019,10,00,2019,10,00 | Chromatin 3D reconstruction from chromosomal contacts using a genetic algorithm | 学術雑誌 | 国際共著 | IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics | Vol.17, Issue 5 |
13 | 学会発表7 | 2019年6月 5日~2019年6月 5日2019,06,05,2019,06,05 | 畳み込みニューラルネットワークの学習過程の可視化 | 2Q3-J-2-05 | |||
14 | 学会発表7 | 2019年3月 15日~2019年3月 15日2019,03,15,2019,03,15 | 回帰における多重共線性の全整数最適化アプローチ | 2-B-10 | |||
15 | 学会発表7 | 2019年3月 14日~2019年3月 14日2019,03,14,2019,03,14 | 明治民法制定時における日仏民法条文の参照関係再推定 | P-1-24 | |||
16 | 国際学会8 | 2019年1月 5日~2019年1月 5日2019,01,05,2019,01,05 | Transition of regulatory force toward the gene expressions during osteoblast cell | 単著 | |||
17 | 学会発表7 | 2018年11月 23日~2018年11月 23日2018,11,23,2018,11,23 | TgAb出現が一致しない一卵性双生児ペアを対象とした、自己抗体出現に関するエピゲノム要因の解析 | ||||
18 | 学会発表7 | 2018年11月 8日~2018年11月 8日2018,11,08,2018,11,08 | 自己抗体の出現が一致しない一卵性双生児を対象とした、自己抗体出現に影響する遺伝要因とエピゲノム要因の解析 | ||||
19 | 国際学会8 | 2018年11月 7日~2018年11月 7日2018,11,07,2018,11,07 | Nonconvex Discrete Optimization Approach for Highdimensional Regression | 学術雑誌 | 国際共著 | ||
20 | 国際学会8 | 2018年11月 7日~2018年11月 7日2018,11,07,2018,11,07 | Nonconvex Discrete Optimization Approach for High Dimensional Regression | 学術雑誌 | 国際共著 | ||
21 | 国際学会8 | 2018年7月 31日~2018年7月 31日2018,07,31,2018,07,31 | Genotype-based epigenetic factors in identical twins discordant for positive TgAb | 共著 | AACC Annual Meeting & Clinical Lab Expo 2018 | ||
22 | 学会発表7 | 2018年5月 24日~2018年5月 24日2018,05,24,2018,05,24 | 自己抗体の出現が不一致な一卵性双生児における、個体の遺伝背景を考慮したDNAメチル化率の解析 | ||||
23 | 論文1 | 2018年5月 ~2018年5月 2018,05,00,2018,05,00 | Automated transition analysis of activated gene regulation during diauxic nutrient shift in Escherichia coli and adipocyte differentiation in mouse cells | 学術雑誌 | 国内共著 | BMC bioinformatics | vol 19(suppl 4):89 |
24 | 論文1 | 2018年2月 ~2018年2月 2018,02,00,2018,02,00 | Collaborative environmental DNA sampling from petal surfaces of flowering cherry Cerasus × yedoensis 'Somei-yoshino' | 学術雑誌 | 国内共著 | Journal of Plant Research | 131(4) pp.709-171 |
25 | 学会発表7 | 2018年1月 27日~2018年1月 27日2018,01,27,2018,01,27 | 一卵性双生児を対象とした HbA1c 値に影響するゲノムおよびエピゲノム因子の探索 | 演題8 | |||
26 | 国際学会8 | 2018年1月 15日~2018年1月 17日2018,01,15,2018,01,17 | Functional analysis of metagenome using composition- based method | 共著 | The 16th Asia Pacific Bioinformatics Conference | A18 | |
27 | 論文1 | 2017年12月 ~2017年12月 2017,12,00,2017,12,00 | Diagnostic assessment of deep learning algorithms for detection of lymph node metastases in women with breast cancer | 学術雑誌 | 国際共著 | The Journal of the American Medical Association | Vol.318, No.22, pp.2199-2210 |
28 | 学会発表7 | 2017年10月 7日~2017年10月 7日2017,10,07,2017,10,07 | 一卵性双生児を対象としたHbA1c値に影響する遺伝因子と環境因子の探索 | ||||
29 | 学会発表7 | 2017年8月 ~2017年8月 2017,08,00,2017,08,00 | 蛍光顕微鏡画像のためのグラフカットによる毛細血管の抽出手法 | ||||
30 | 学会発表7 | 2017年5月 23日~2017年5月 24日2017,05,23,2017,05,24 | お花見メタゲノムプロジェクト結果報告 | 国内共著 | |||
31 | 学会発表7 | 2017年5月 23日~2017年5月 24日2017,05,23,2017,05,24 | 一細胞解析のための潜在的ディリクレ配分法を用いた遺伝子群の機能予測手法 | ||||
32 | 学会発表7 | 2017年2月 2017,02,00,,, | 細胞個体の移動傾向の違いを考慮したグローバルデータアソシエーションを用いた細胞追跡手法 | 単行本 | 共著 | 第112回数理モデル化と問題解決研究発表会 | 2017-MPS-112-6 |
33 | 学会発表7 | 2017年2月 2017,02,00,,, | 畳み込みニューラルネットワークを用いた脂肪細胞セグメンテーションにおける分割精度改善手法の提案 | 単行本 | 共著 | 第112回数理モデル化と問題解決研究発表会 | 2017-MPS-112-27 |
34 | 論文1 | 2017年1月 ~2017年1月 2017,01,00,2017,01,00 | Genotype-based epigenetic differences in monozygotic twins discordant for positive anti-thyroglobulin autoantibodies | 学術雑誌 | 国内共著 | Thyroid | 28(1), 110-123 |
35 | 国際学会8 | 2016年11月 1日2016,11,01,,, | Comparative analysis of transformation methods for gene expression profiles in breast cancer datasets | 単行本 | 共著 | IEEE 16th International Conference on Bioinformatics and Bioengineering (BIBE 2016) | pp.328-333 |
36 | 国際学会8 | 2016年7月 2016,07,00,,, | An accurate estimation method for expression profiles of novel transcripts from RNA-Seq data, | 共著 | International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2016) | No.N24 | |
37 | 国際学会8 | 2016年7月 2016,07,00,,, | A method for reducing false positives of target genes of microRNAs by combining two prediction tools | 共著 | International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2016), | No.O49 | |
38 | 学会発表7 | 2016年6月 2016,06,00,,, | オプティカルフローとウェーブレット解析を用いた白血球の動態の解析手法 | 単行本 | 共著 | バイオイメージ・インフォマティクスワークショップ 2016 | P03 |
39 | 学会発表7 | 2016年6月 2016,06,00,,, | 画像処理とディープラーニングの手法を用いた病理診断支援 | 単行本 | 共著 | バイオイメージ・インフォマティクスワークショップ 2016 | P23 |
40 | 国際学会8 | 2016年4月 2016,04,00,,, | Bayesian Network Inference from gene expression profiles with a small number of samples | 共著 | The 20th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology,RECOMB2016 | Poster-50 | |
41 | 国際学会8 | 2016年4月 2016,04,00,,, | Dynamic Analysis of Gene Regulations using Leaving-One-Out Expression Profile, | 共著 | The 20th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology, RECOMB2016 | Poster-48 | |
42 | 論文1 | 2016年3月 2016,03,00,,, | Similarity Measure among Structures of Local Government Statute Books based on Tree Edit Distance | 学術雑誌 | 共著 | Journal of Open Access to Law | Vol. 4, No.1 |
43 | 学会発表7 | 2016年3月 2016,03,00,,, | オプティカルフローを用いた3次元生体イメージングデータからの細胞動態の解析 | 共著 | 第201回CVIM研究会 | ||
44 | 学会発表7 | 2016年3月 2016,03,00,,, | コンポーネントツリーとデータアソシエーションを用いた細胞追跡手法 | 単行本 | 共著 | 第107回数理モデル化と問題解決研究発表会 | 2016-MPS-107-6 |
45 | 学会発表7 | 2016年3月 2016,03,00,,, | Deep learningを用いた脂肪組織画像における細胞の認識 | 単行本 | 共著 | 第107回数理モデル化と問題解決研究発表会 | 2016-MPS-107-10 |
46 | 学会発表7 | 2016年3月 2016,03,00,,, | 小サンプル数データに対するベイジアンネットワークのスコアベース構造学習改善手法 | 単行本 | 共著 | 第45回バイオ情報学研究発表会 | 2016-BIO-45-1 |
47 | 学会発表7 | 2016年3月 2016,03,00,,, | 乳癌データベースを用いた遺伝子発現プロファイルの数値変換の検討 | 単行本 | 共著 | 第45回バイオ情報学研究発表会 | 2016-BIO-45-7 |
48 | 国際学会8 | 2015年11月 2015,11,00,,, | Identification of the state-change-time-point of gene regulations from time-course experiments | 単著 | The second workshop on Advanced Methodologies for Bayesian Networks | ||
49 | 国際学会8 | 2015年10月 2015,10,00,,, | Similarity Measure among Structures of Local Government Statute Books based on Tree Edit Distance | 単行本 | 共著 | The 7th international conference on Knowledge and Systems Engineering (KSE 2015) | No. 10, pp. 49-54 |
50 | 論文1 | 2015年9月 2015,09,00,,, | Detecting shifts in gene regulatory networks during time-course experiments at single-time-point temporal resolution | 学術雑誌 | 共著 | J. Bioinformatics and Computational Biology | vol. 13 Issue 5 |
51 | 国際学会8 | 2015年9月 2015,09,00,,, | Detecting the shifts of gene regulatory networks during time-course experiments with a single time point temporal resolution | 単行本 | 共著 | Proceeding of GIW/InCoB2015 | J13 |
52 | 学会発表7 | 2015年7月 2015,07,00,,, | 共通k-mer種別数に基づくメタゲノム分類手法 | 共著 | 第4回NGS現場の会 | ||
53 | 学会発表7 | 2015年7月 2015,07,00,,, | 風が吹くといつ桶屋は儲かるの? 遺伝子発現制御の時間変化解析 | 単著 | 第4回NGS現場の会 | ||
54 | 学会発表7 | 2015年6月 2015,06,00,,, | オプティカルフローを用いた血管中を遊走する白血球の動態の解析手法 | 共著 | バイオイメージインフォマティクス・ワークショップ2015 | ||
55 | 学会発表7 | 2015年6月 2015,06,00,,, | コンポーネントツリーを用いたグローバルデータアソシエーションによる細胞追跡手法 | 共著 | バイオイメージインフォマティクス・ワークショップ2015 | ||
56 | 学会発表7 | 2015年6月 2015,06,00,,, | ダイナミックベイジアンネットワークを用いた遺伝子制御ネットワーク推定の部分問題化による近似解法 | 共著 | 情報処理学会研究報告, 第42回バイオ情報学研究会 | ||
57 | 論文1 | 2015年3月 2015,03,00,,, | 都道府県の類似例規の抽出と応用 | 学術雑誌 | 共著 | 情報処理学会論文誌 数理モデル化と応用 | 8巻・1号, pp.80-86 |
58 | 国際学会8 | 2015年3月 2015,03,00,,, | A rendering method based on local maximum intensity projection for in vivo cellular imaging | 単行本 | 共著 | Proceedings of Medical and Biological Imaging - JSMBE | JSMBE-MBI2014-2 |
59 | 学会発表7 | 2015年3月 2015,03,00,,, | 木構造編集距離に基づく都道府県例規集構造の類似性評価 | 単行本 | 共著 | 言語処理学会第21回年次大会 | C2-4 |
60 | 学会発表7 | 2014年11月 2014,11,00,,, | イベントヒストリー分析を用いたバイオイメージングデータの解析手法 | 単行本 | 共著 | 第37回日本分子生物学会年会 | 3P-962 |
61 | 国際学会8 | 2014年10月 2014,10,00,,, | An automatic event detection method using semi-supervised learning for time-lapse imaging data | 共著 | Bioimage Informatics 2014 | P22 | |
62 | 国際学会8 | 2014年10月 2014,10,00,,, | Improvement approach of cell tracking accuracy by using inter-frame information | 共著 | Bioimage Informatics 2014 | P38 | |
63 | 論文1 | 2014年9月 2014,09,00,,, | Metagenome fragment classification based on multiple motif-occurrence profiles | 学術雑誌 | 共著 | PeerJ | ( 2 : e559 ) |
64 | 学会発表7 | 2014年9月 2014,09,00,,, | 大域データ対応付けの反復実行による細胞追跡精度の改善手法 | 共著 | 情報処理学会研究報告, 第39回バイオ情報学研究会 | ||
65 | 学会発表7 | 2014年9月 2014,09,00,,, | リードの由来階級の既知・未知予測に基づくメタゲノム配列の系統分類手法 | 共著 | 情報処理学会研究報告, 第39回バイオ情報学研究会 | ||
66 | 学会発表7 | 2014年9月 2014,09,00,,, | 都道府県に共通する例規の抽出と応用 | 単行本 | 共著 | 情報処理学会研究報告, 第100回数理モデル化と問題解決研究会 | 2014-MPS-100-5 |
67 | 国際学会8 | 2014年7月 2014,07,00,,, | Chronological analysis of regulatory strength on gene regulatory networks | 共著 | 13rd European Conference on Computational Biology ( ECCB2014 ) | B04 | |
68 | 学会発表7 | 2014年6月 2014,06,00,,, | ベイジアンネットワークによる遺伝子制御ネットワーク推定結果の反復構築のための計算速度向上手法 | 単行本 | 共著 | 情報処理学会研究報告, 第98回数理モデル化と問題解決研究会 | 2014-MPS-98-9 |
69 | 学会発表7 | 2014年6月 2014,06,00,,, | タイムラプスイメージングによる細胞周期観測画像の時空間解析 | 共著 | バイオイメージ・インフォマティクスワークショップ 2014 | ||
70 | 学会発表7 | 2014年3月 2014,03,00,,, | マルチチャンネル蛍光顕微鏡動画のためのパーティクルフィルタを用いた細胞追跡手法 | 単行本 | 共著 | 情報処理学会第76回全国大会 | 5K-5 |
71 | 学会発表7 | 2014年3月 2014,03,00,,, | 都道府県に共通する例規の自動抽出 | 単行本 | 共著 | 言語処理学会第20回年次大会 | B6-4 |
72 | 論文1 | 2013年12月 2013,12,00,,, | 複数時系列遺伝子発現プロファイルを利用した遺伝子制御ネットワーク推定の精度向上手法 | 学術雑誌 | 共著 | 情報処理学会論文誌 数理モデル化と応用 | Vol.6, No.3, pp.151-162 |
73 | 論文1 | 2013年12月 2013,12,00,,, | 混合正規分布モデルを用いた経時観測蛍光画像からの細胞核の検出と追跡手法 | 学術雑誌 | 共著 | 情報処理学会論文誌 数理モデル化と応用 | Vol.6, No.3, pp.140-150 |
74 | 学会発表7 | 2013年12月 2013,12,00,,, | 時系列発現プロファイルを用いた時期特異的に機能するPPIサブネットワークの探索手法 | 単行本 | 共著 | 第36回日本分子生物学会年会 | 2P-1053 |
75 | 国際学会8 | 2013年11月 2013,11,00,,, | Integrative prediction of miRNA-mRNA interactions from high-throughput sequencing data | 共著 | RECOMB/ISCB Conference on Regulatory and Systems Genomics, with DREAM Challenges 2013 | ||
76 | 学会発表7 | 2013年10月 2013,10,00,,, | Estimation method of large-scale dynamic gene regulatory networks for cell differentiation by separation of time-course data | 単行本 | 共著 | 2013年日本バイオインフォマティクス学会年会 | 47 |
77 | 学会発表7 | 2013年9月 2013,09,00,,, | 長いリードを計算機で扱うのに完全線形符号が効果的だと思うのです | 単行本 | 共著 | 第三回NGS現場の会 | 7-13-A |
78 | 学会発表7 | 2013年9月 2013,09,00,,, | RNA-seqデータを用いたDifferential Alternative Splicingの検出ツールの比較考察 | 単行本 | 共著 | 第三回NGS現場の会 | 3-28-A |
79 | 学会発表7 | 2013年9月 2013,09,00,,, | 多次元尺度構成法によるリード分類結果の視覚化 | 単行本 | 共著 | 第三回NGS現場の会 | 5-19-B |
80 | 学会発表7 | 2013年8月 2013,08,00,,, | 経時観測蛍光画像からのモーションヒストリーイメージを用いた細胞分裂の検出方法 | 単行本 | 共著 | 第16回画像の認識・理解シンポジウム MIRU2013 | SS6-18 |
81 | 国際学会8 | 2013年7月 2013,07,00,,, | Reconstruction of Dynamic Gene Regulatory Networks for Cell Differentiation by Separation of Time-course Data | 共著 | The 2013 World Congress in Computer Science Computer Engineering and Applied Computing | ||
82 | 国際学会8 | 2013年7月 2013,07,00,,, | A Method of Sequence Analysis for High-Throughput Sequencer Data Based on Shifted Short Read Clustering | 共著 | The 2013 World Congress in Computer Science Computer Engineering and Applied Computing | ||
83 | 国際学会8 | 2013年7月 2013,07,00,,, | Gene Set Enrichment Analysis for a Long Time Series Gene Expression Profile | 共著 | The 2013 World Congress in Computer Science Computer Engineering and Applied Computing | ||
84 | 国際学会8 | 2013年7月 2013,07,00,,, | Gene Set Enrichment Analysis for Time-Series Gene Expression Profile | 共著 | 35th Annual International IEEE EMBS Conference, 2013 IEEE EMBC | ||
85 | 国際学会8 | 2013年7月 2013,07,00,,, | Multiplication of Motif Occurrence Profiles for Metagenome Fragment Classification | 共著 | 35th Annual International IEEE EMBS Conference, 2013 IEEE EMBC | ||
86 | 学会発表7 | 2013年7月 2013,07,00,,, | Global Data Associationによる経時観察画像における破骨前駆細胞の自動追跡手法 | 単行本 | 共著 | 第16回画像の認識・理解シンポジウム MIRU2013 | SS3-37 |
87 | 論文1 | 2013年4月 2013,04,00,,, | An estimation method for a cellular-statespecific gene regulatory network along tree-structured gene expression profiles | 学術雑誌 | 共著 | Gene | (518), pp.17-25 |
88 | 学会発表7 | 2013年3月 2013,03,00,,, | Improvement of the Accuracy of Mapping by Composing Alleles | 単行本 | 共著 | 情報処理学会 第75回全国大会 | IB-6 |
89 | 学会発表7 | 2013年2月 2013,02,00,,, | 混合正規分布モデルを用いた経時観測蛍光画像からの細胞核の検出と追跡手法 | 単行本 | 共著 | 情報処理学会研究報告 第92回数理モデル化と問題解決 | 2013-MPS-92,No. 5 |
90 | 学会発表7 | 2013年2月 2013,02,00,,, | 複数時系列遺伝子発現プロファイルを利用した遺伝子制御ネットワーク推定の精度向上手法 | 単行本 | 共著 | 情報処理学会研究報告 第92回数理モデル化と問題解決 | 2013-MPS-92,No. 12 |
91 | 国際学会8 | 2012年12月 2012,12,00,,, | An estimation method for a cellular-state-specific gene regulatory network along tree-structured gene expression profiles | 共著 | Proceedings of the 2012 International Conference on Genome Informatics (GIW2012) | ||
92 | 国際学会8 | 2012年12月 2012,12,00,,, | Estimate Dynamic Gene Regulatory Networks in Adipocyte Differentiation for Detecting Changes of Gene Regulations by Splitting Time Course Data | 共著 | The 23rd International Conference on Genome Informatics (GIW2012) | ||
93 | 学会発表7 | 2012年12月 2012,12,00,,, | 多色蛍光イメージングによる経時観測データのための細胞追跡手法 | 共著 | ビジョン技術の実利用ワークショップ(VIEW2012) | ||
94 | 学会発表7 | 2012年12月 2012,12,00,,, | An automatic cell-tracking method and spatiotemporal analysis for time-lapse multicolor fluorescent images of cell cycle | 共著 | 第35回分子生物学会年会 | ||
95 | 学会発表7 | 2012年12月 2012,12,00,,, | Measuring Transcript-Type Dependent Expression Levels of ncRNAs in RNA-Seq Analysis | 共著 | 第35回分子生物学会年会 | ||
96 | 学会発表7 | 2012年11月 2012,11,00,,, | A cell-tracking method for time-lapse multicolor fluorescent images | 単行本 | 共著 | バイオイメージ・インフォマティクス ワークショップ2012 | p.57 |
97 | 国際学会8 | 2012年10月 2012,10,00,,, | Transcript-Type Dependent Normalization of Expression Levels in RNA-Seq Data for Non-Coding RNA Analysis | 共著 | Joint Conference on Informatics is Biology, Medicine and Pharmacology | ||
98 | 国際学会8 | 2012年10月 2012,10,00,,, | Comparison of Gene Expressions measured by RNA-seq and Microarray for Transcriptome Analysis of Adipose Tissues | 共著 | Joint Conference on Informatics is Biology, Medicine and Pharmacology | ||
99 | 国際学会8 | 2012年10月 2012,10,00,,, | Two-stage method to infer gene regulatory network utilizing Link Prediction | 共著 | Joint Conference on Informatics is Biology, Medicine and Pharmacology | ||
100 | 国際学会8 | 2012年10月 2012,10,00,,, | Estimation of Dynamic Gene Regulatory Networks for Cell Differentiation by Splitting Time Course Data | 共著 | Joint Conference on Informatics in Biology, Medicine and Pharmacology | ||
101 | 国際学会8 | 2012年10月 2012,10,00,,, | Bayes-based inference of gene regulatory network for multiple time series gene expression profile | 共著 | Joint Conference on Informatics in Biology, Medicine and Pharmacology | ||
102 | 国際学会8 | 2012年10月 2012,10,00,,, | Automatic cell tracking for time-lapse fluorescent images of cell cycle | 共著 | Towards Comprehensive Understanding of Immune Dynamism (TCUID 2012) | ||
103 | 学会発表7 | 2012年10月 2012,10,00,,, | Two-stage method to infer gene regulatory network utilizing Link Prediction | 単行本 | 共著 | 生命医薬情報学連合大会 | B73_132 |
104 | 学会発表7 | 2012年10月 2012,10,00,,, | Comparison of Gene Expressions measured by RNA-seq and Microarray for Transcriptome Analysis of Adipose Tissues | 単行本 | 共著 | 生命医薬情報学連合大会 | B72_115 |
105 | 学会発表7 | 2012年10月 2012,10,00,,, | Transcript-Type Dependent Normalization of Expression Levels in RNA-Seq Data for Non-Coding RNA Analysis | 単行本 | 共著 | 生命医薬情報学連合大会 | B71_74 |
106 | 学会発表7 | 2012年10月 2012,10,00,,, | Bayes-based inference of gene regulatory network for multiple time series gene expression profile | 単行本 | 共著 | 生命医薬情報学連合大会 | JSBi-29 (B70_29) |
107 | 論文1 | 2012年9月 2012,09,00,,, | 地方自治体の例規比較に用いる条文対応表の作成支援 | 学術雑誌 | 共著 | 自然言語処理 | 第19巻 第3号,pp193-212 |
108 | 国際学会8 | 2012年7月 2012,07,00,,, | All the 1+3n one-mismatch sequences of n-mer DNA are involved in 22.2+0.00879n strings of Perfect Linear Code words on DNA | 共著 | International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2012) | U44 | |
109 | 学会発表7 | 2012年6月 2012,06,00,,, | A Method for Isoform Prediction from RNA-Seq Data by Iterative Mapping | 単行本 | 共著 | 情報処理学会研究報告 第29回バイオ情報学研究発表会 | Vol.2012-BIO-29, No.13, pp.1-7 |
110 | 学会発表7 | 2012年6月 2012,06,00,,, | 時系列発現プロファイルのための遺伝子機能グループ解析手法 | 単行本 | 共著 | 情報処理学会研究報告 第29回バイオ情報学研究発表会 | Vol.2012-BIO-20, No.26, pp.141-147 |
111 | 学会発表7 | 2012年5月 2012,05,00,,, | ゲノムマッピング: Burrows-Wheeler transformの次のアルゴリズム | 単著 | NGS現場の会 第二回研究会 | ||
112 | 論文1 | 2012年4月 2012,04,00,,, | A method for isoform prediction from RNA-Seq data by iterative mapping | 学術雑誌 | 共著 | IPSJ Transactions on Bioinformatics | ( 5 ), pp.27-33 |
113 | 学会発表7 | 2012年3月 2012,03,00,,, | 近隣リードを考慮したショートリードクラスタリングによる塩基配列構造の有向非循環グラフ表現 | 単行本 | 共著 | 情報処理学会研究報告 第87回 数理モデル化と問題解決 | 2012-MPS-87-27 |
114 | 論文1 | 2012年1月 2012,01,00,,, | An Estimation Method for Inference of Gene Regulatory Network Using Bayesian Network with Uniting of Partial Problems | 学術雑誌 | 共著 | BMC Genomics | (13 - suppl. 1) |
115 | 国際学会8 | 2012年1月 2012,01,00,,, | An Estimation Method for Inference of Gene Regulatory Network Using Bayesian Network with Uniting of Partial Problems | 単行本 | 共著 | The tenth Asia Pacific Bioinformatics Conference (APBC2012) | A3.1 |
116 | 論文1 | 2011年12月 2011,12,00,,, | Inference of S-system Models of Gene Regulatory Networks using Immune Algorithm | 学術雑誌 | 共著 | Journal of Bioinformatics and Computational Biology | ( 9 - suppl. 1) |
117 | 国際学会8 | 2011年12月 2011,12,00,,, | Inference of S-system Models of Gene Regulatory Networks using Immune Algorithm | 共著 | Proceedings of the 2011 International Conference on Genome Informatics (GIW2011) | ||
118 | 国際学会8 | 2011年12月 2011,12,00,,, | A random forest approach to the detection of a rare disease in the case control studies | 共著 | The 22nd International Conference on Genome Informatics (GIW 2011) | ||
119 | 論文1 | 2011年11月 2011,11,00,,, | 細胞分化クロストークのモデル化と細胞分化クロストーク遺伝子の推定手法 | 学術雑誌 | 共著 | 情報処理学会論文誌 数理モデル化と応用(TOM) | 第4巻・第4号, pp.59-68 |
120 | 論文1 | 2011年11月 2011,11,00,,, | Perfect Hamming code with a hash table for faster genome mapping | 学術雑誌 | 共著 | BMC Genomics | (12 - suppl. 3), S3 |
121 | 国際学会8 | 2011年11月 2011,11,00,,, | Mutation-aware clustering with error correction for short-read genome mapping | 単行本 | 共著 | The 2011 Joint Conference of CBI&JSBi | JSBi-27 |
122 | 国際学会8 | 2011年11月 2011,11,00,,, | Perfect Hamming code with a hash table for faster genome mapping | 単行本 | 共著 | Asia Pacific Bioinformatics Network's 10th InCoB - 1st ISCB Asia Joint Conference 2011 | 3.2 |
123 | 国際学会8 | 2011年11月 2011,11,00,,, | Network analysis for time-series expression profile using nested effects models | 共著 | The 2011 Joint Conference of CBI & JSBi, | JSBi-49 | |
124 | 国際学会8 | 2011年11月 2011,11,00,,, | Sequence determination and expression estimation of alleles from RNA-Seq data | 共著 | Asia Pacific Bioinformatics Network's 10th InCoB - 1st ISCB Asia Joint Conference 2011 | No.138 | |
125 | 国際学会8 | 2011年11月 2011,11,00,,, | Detect unique gene regulatory networks along dendrogram of cell differentiation | 共著 | Asia Pacific Bioinformatics Network's 10th InCoB - 1st ISCB Asia Joint Conference 2011 | No. 156 | |
126 | 国際学会8 | 2011年11月 2011,11,00,,, | Perfect Hamming code with Burrow-Wheeler translation for genome mapping | 共著 | Asia Pacific Bioinformatics Network's 10th InCoB - 1st ISCB Asia Joint Conference 2011 | No. 134 | |
127 | 国際学会8 | 2011年7月 2011,07,00,,, | A Method for Inference of Gene Regulatory Network based on Bayesian Network with Uniting of Partial Problems | 共著 | Proceedings of 19th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 10th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB2011) | N13 | |
128 | 国際学会8 | 2011年7月 2011,07,00,,, | A Directed Graphical Gaussian Model for Inferring Gene Regulatory Networks | 共著 | Proceedings of 19th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 10th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB2011), | X16 | |
129 | 国際学会8 | 2011年7月 2011,07,00,,, | Perfect Hamming Code as Hash key for Fast Genome Mapping | 共著 | Proceedings of 19th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 10th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB2011) | U22 | |
130 | 国際学会8 | 2011年7月 2011,07,00,,, | Feature selection for specifying experimental conditions that activate gene transcriptions | 共著 | Proceedings of 19th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 10th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB2011) | M13 | |
131 | 国際学会8 | 2011年7月 2011,07,00,,, | A method for risk prediction of a serious disease using rule-based analysis | 共著 | Proceedings of 19th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 10th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB2011) | N13 | |
132 | 学会発表7 | 2011年6月 2011,06,00,,, | 生物情報解析ワークフローのためのRESTサービスのSOAPサービス変換手法 | 単行本 | 共著 | 情報処理学会研究報告 第25回バイオ情報学研究発表会 | 2011-BIO-25-9 |
133 | 学会発表7 | 2011年3月 2011,03,00,,, | 細胞分化クロストークのモデル化と細胞分化クロストーク遺伝子の推定手法 | 単行本 | 共著 | 情報処理学会研究報告 数理モデル化と問題解決 | 2010-MPS-82-10 |
134 | 学会発表7 | 2011年3月 2011,03,00,,, | 地方自治体の例規比較に用いる条文対応表の自動生成 | 単行本 | 共著 | 言語処理学会 第17回年次大会 発表論文集 | pp.520-523 (D2-5) |
135 | 国際学会8 | 2010年12月 2010,12,00,,, | An Improved RNA-Seq Analysis Method for Isoform Prediction by Iterative Mapping | 単行本 | 共著 | Proceedings of the 2010 International Conference on Genome Informatics (GIW2010) | No.8 |
136 | 国際学会8 | 2010年12月 2010,12,00,,, | Revealing regulatory relationships of crosstalk with multiple time-series gene expression profiles | 共著 | Proc. the 2010 Annual Conference of the Japanese Society for Bioinformatics (JSBi2010) | P017 | |
137 | 国際学会8 | 2010年12月 2010,12,00,,, | A bootstrapping method of S-system model for estimating timeline gene regulatory networks | 共著 | Proc. the 2010 Annual Conference of the Japanese Society for Bioinformatics (JSBi2010) | P027 | |
138 | 国際学会8 | 2010年9月 2010,09,00,,, | A Metadata Management System for Composing Bioinformatics Workflows | 単行本 | 共著 | Proceedings of the 9th International Conference on Bioinformatics (InCoB2010) | No.187 |
139 | 国際学会8 | 2010年7月 2010,07,00,,, | An algorithm for fast exact search of chemical compounds by clustered data beforehand | 共著 | Proceedings of the 21st International Workshop on Combinatorial Algorithms | ||
140 | 国際学会8 | 2010年7月 2010,07,00,,, | A method for predicting compound-protein interactions using canonical correlational analysis | 共著 | Proc. 18th Annual International Conference on Intelligent Sysmtes for Molecular Biology, | M015 | |
141 | 国際学会8 | 2010年7月 2010,07,00,,, | A method for detecting structural variants from massive paired end genome sequences by mapping signatures | 共著 | Proc. 18th Annual International Conference on Intelligent Sysmtes for Molecular Biology, | U041 | |
142 | 国際学会8 | 2010年7月 2010,07,00,,, | An estimation method of S-system model of gene regulatory networks using immune algorithm | 共著 | Proc. 18th Annual International Conference on Intelligent Sysmtes for Molecular Biology | X060 | |
143 | 論文1 | 2010年4月 2010,04,00,,, | Gene expression profile prospectively predicts peritoneal relapse after curative surgery of gastric cancer | 学術雑誌 | 共著 | Annals of Surgical Oncology | ( 17 - 4 ), pp.1033-1042 |
144 | 論文1 | 2010年3月 2010,03,00,,, | Improved prediction method for protein interactions using both structural and functional characteristics of proteins | 学術雑誌 | 共著 | IPSJ Transactions on Bioinformatics | ( 3 ), pp.10-23 |
145 | 学会発表7 | 2010年3月 2010,03,00,,, | An approach for efficient computational analysis of massive RNA-Seq data | 単行本 | 共著 | 第32回日本分子生物学会年会(MBSJ2009) | 2P-0033 |
146 | 学会発表7 | 2010年3月 2010,03,00,,, | 立体構造情報と機能情報によるタンパク質間相互作用予測法の改良 | 単行本 | 共著 | 情報処理学会研究報告 バイオ情報学研究会 | 2009-BIO-20-1 |
147 | 学会発表7 | 2010年3月 2010,03,00,,, | 立体構造情報と機能情報によるタンパク質間相互作用予測法の改良 | 単行本 | 共著 | 情報処理学会研究報告 バイオ情報学研究会 | 2009-BIO-20-7 |
148 | 国際学会8 | 2009年12月 2009,12,00,,, | A Method for Efficient Execution of Bioinformatics Workflows | 単行本 | 共著 | Genome Informatics (GIW2009) | vol.23, pp.139-148 |
149 | 国際学会8 | 2009年12月 2009,12,00,,, | A Method of Estimation of Crosstalk Genes with Multiple Time-Series Gene Expression Profiles | 共著 | Proceedings of the 20th International Conference on Genome Informatics (GIW2009) | P057 | |
150 | 国際学会8 | 2009年12月 2009,12,00,,, | A Method for Extraction of the Active Compound Groups which Have Strong Relationship between Structure and Activity | 共著 | Proceedings of the 20th International Conference on Genome Informatics (GIW2009) | P133 | |
151 | 国際学会8 | 2009年6月 2009,06,00,,, | A Method for Inference of Gene Regulatory Networks based on Bayesian Network with Clustering of Time-Series Subsequences | 共著 | Proceedings of 17th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 8th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB2009) | X67 | |
152 | 国際学会8 | 2009年6月 2009,06,00,,, | A Method for Analyzing Gene Expression Profiles based on the Underlying Structures | 共著 | Proceedings of 17th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 8th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB2009) | M21 | |
153 | 論文1 | 2009年4月 2009,04,00,,, | The transcriptional network that controls growth arrest and differentiation in a human myeloid leukemia cell line | 学術雑誌 | 共著 | Nature Genetics | ( 41- 5 ), pp.553-562 |
154 | 学会発表7 | 2009年3月 2009,03,00,,, | Webサービス情報の統合のためのレポジトリ連携手法の提案 | 単行本 | 共著 | 情報処理学会研究報告 バイオ情報学研究会 | 2009-BIO-16-1 |
155 | 国際学会8 | 2008年12月 2008,12,00,,, | A Method for Making a New Reference Set of PDB Entries for Retrieving Protein 3D Structures with Structural Annotations | 単行本 | 共著 | Proceedings of the 2008 Annual Conference of the Japanese Society for Bioinformatics | P074/T02 |
156 | 国際学会8 | 2008年12月 2008,12,00,,, | A Method for Reducing Bounds of Compound Search by Dividing Structure Key | 単行本 | 共著 | Proceedings of the 2008 Annual Conference of the Japanese Society for Bioinformatics | P077/T01 |
157 | 国際学会8 | 2008年12月 2008,12,00,,, | Architecture of an Efficient Data Transfer System and Manager for Genome-wide Analysis Workflows | 共著 | The 3rd MEI International Symposium | ||
158 | 国際学会8 | 2008年12月 2008,12,00,,, | A Method for Analysis of Tissue-Specific Transcriptional Control Using Distributions of Transcription Starting Sites | 共著 | Proceedings of the 2008 Annual Conference of the Japanese Society for Bioinformatics | P044 | |
159 | 国際学会8 | 2008年12月 2008,12,00,,, | The Validity Evaluation of Gene Regulatory Network Motifs Based on Differential Equation Model | 共著 | Proceedings of the 2008 Annual Conference of the Japanese Society for Bioinformatics | P045 | |
160 | 国際学会8 | 2008年12月 2008,12,00,,, | An Efficient Data Transfer on Workflows for Genome-wide Analysis | 共著 | Proceedings of the 2008 Annual Conference of the Japanese Society for Bioinformatics | P075 | |
161 | 学会発表7 | 2008年12月 2008,12,00,,, | 脂肪細胞・骨芽細胞分化における遺伝子制御ネットワークの推定 | 単行本 | 共著 | 第31回日本分子生物学会・第81回日本生化学会大会合同大会講演予稿集 | 4S8-2 |
162 | 学会発表7 | 2008年9月 2008,09,00,,, | 構造キーの分割によるTanimoto係数を用いた化合物検索の計算範囲の絞り込み手法 | 単行本 | 共著 | 情報処理学会研究報告 バイオ情報学研究会 | 2008-BIO-14-2 |
163 | 国際学会8 | 2008年7月 2008,07,00,,, | Tissue specificity measured by differences in information content between target tissue and whole tissue | 共著 | Proceedings of International Society for Computational Bilogy 2008 | A21 | |
164 | 国際学会8 | 2008年7月 2008,07,00,,, | A Clustering Method for Expression Patterns of Transcription Starting Sites | 共著 | Proceedings of International Society for Computational Bilogy 2008 | J29 | |
165 | 国際学会8 | 2008年7月 2008,07,00,,, | A Data Transmission Method for Web Services in Bioinformatics Workflows | 共著 | Proceedings of International Society for Computational Biology 2008 | E36 | |
166 | 国際学会8 | 2008年7月 2008,07,00,,, | A method for analysis of tissue-specific alternative transcripts using CAGE tags | 共著 | Proceedings of International Society for Computational Bilogy 2008 | J30 | |
167 | 学会発表7 | 2008年5月 2008,05,00,,, | 化合物フィンガープリントを用いた活性サブクラスの抽出手法 | 共著 | 日本分子生物学会第8回春季シンポジウム | ||
168 | 学会発表7 | 2008年5月 2008,05,00,,, | CAGE発現プロファイルを用いた転写開始点の発現パターンのクラスタリング手法 | 共著 | 日本分子生物学会第8回春季シンポジウム | ||
169 | 論文1 | 2008年3月 2008,03,00,,, | A Distributed-Processing System for Accelerating Biological Research using Data-Staging | 学術雑誌 | 共著 | IPSJ Transactions on Bioinformatics | ( 49 ), pp.58-64 |
170 | 論文1 | 2008年3月 2008,03,00,,, | A Combination Method of the Tanimoto Coefficient and Proximity Measure of Random Forest for Compound Activity Prediction | 学術雑誌 | 共著 | IPSJ Transactions on Bioinformatics | ( 49 ), pp.46-57 |
171 | 学会発表7 | 2008年3月 2008,03,00,,, | A Combination method between Tanimoto coefficient and Proximity Measure of Random Forest for Compound Activity Prediction | 単行本 | 共著 | 情報処理学会研究報告 バイオ情報学研究会 | 2008-BIO-12-6 |
172 | 学会発表7 | 2008年3月 2008,03,00,,, | Tanimoto係数の性質に基づく化合物の類似度検索の高速化手法 | 単行本 | 共著 | 情報処理学会研究報告 バイオ情報学研究会 | 2008-BIO-12-7 |
173 | 国際学会8 | 2007年12月 2007,12,00,,, | GO based Tissue Specific Functions of Mouse using Countable Gene Expression Profiles | 学術雑誌 | 共著 | Genome Informatics | Vol 19, pp.154-165 |
174 | 国際学会8 | 2007年12月 2007,12,00,,, | A Method for Retrieving Functionally Similar Bioinformatics Workflows | 共著 | Proceedings of 2007 Annual Conference of Japanese Society for Bioinformatics | P011 | |
175 | 学会発表7 | 2007年12月 2007,12,00,,, | グラフ構造を用いた組織特異的な選択的スプライシングの解析手法 | 単行本 | 共著 | 日本分子生物学会第30回大会 | 1P-1048 |
176 | 学会発表7 | 2007年12月 2007,12,00,,, | TF-IDFフィルタリングによる機能的に類似した生物情報解析ワークフローの検索手法 | 単行本 | 共著 | 情報処理学会研究報告 バイオ情報学研究会 | 2007-BIO-11-57 |
177 | 論文1 | 2007年10月 2007,10,00,,, | Tissue-Specific Functions based on Information Content of Gene Ontology using Cap Analysis Gene Expression | 学術雑誌 | 共著 | Medical and Biological Engineering and Computing | ( 45 ), pp.1029-1036 |
178 | 学会発表7 | 2007年9月 2007,09,00,,, | 生物情報解析ワークフローにおけるデータ転送経路の効率化 | 単行本 | 共著 | 日本ソフトウェア科学会第24回大会予稿集 | 7A-1 |
179 | 論文1 | 2007年3月 2007,03,00,,, | Retrieving Functionally Similar Bioinformatics Workflows using TF-IDF Filtering | 学術雑誌 | 共著 | IPSJ Transactions on Bioinformatics | ( 48 ), pp.20-29 |
180 | 学会発表7 | 2007年3月 2007,03,00,,, | 絶対値発現量を用いた外れ値解析に基づく代謝反応パスウェイの抽出 | 単行本 | 共著 | 情報処理学会研究報告バイオ情報学研究会 | 2007-BIO-8-4 |
181 | 学会発表7 | 2007年3月 2007,03,00,,, | 反応分類番号を用いたパスウェイアライメントの提案 | 単行本 | 共著 | 情報処理学会研究報告バイオ情報学研究会 | 2007-BIO-8-6 |
182 | 学会発表7 | 2007年3月 2007,03,00,,, | バイオインフォマティクス解析におけるWebサービス統合利用のためのメタサービスの提案 | 単行本 | 共著 | 情報処理学会第69回全国大会予稿集 | 2ZB-8 |
183 | 学会発表7 | 2006年12月 2006,12,00,,, | CAGEタグを用いたゲノム領域上の共通発現パターン探索手法 | 単行本 | 共著 | 分子生物学会2006フォーラム要旨集 | 1P-030 |
184 | 学会発表7 | 2006年11月 2006,11,00,,, | 構造記述子の情報量に基づく類似活性化合物の探索手法 | 単行本 | 共著 | 日本薬学会 第34回構造活性相関シンポジウム, 講演要旨集 | KP22 |
185 | 論文1 | 2006年10月 2006,10,00,,, | 遺伝子発現プロファイルを用いた遺伝子制御ネットワーク推定のためのバイクラスタリングの応用 | 学術雑誌 | 共著 | 情報処理学会論文誌 数理モデル化と応用 | 第47巻, No.SIG14, pp.118-128 |
186 | 国際学会8 | 2006年8月 2006,08,00,,, | Inference of Transcriptional Regulatory Networks using CAGE Transcriptome Dataset of Mus musculus | 共著 | Proceedings of World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering | ||
187 | 国際学会8 | 2006年8月 2006,08,00,,, | A Method for Exploring Tissue-Specific Functions based on Information Content of Gene Ontology Terms using CAGE Tags | 共著 | Proceedings of World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering | ||
188 | 国際学会8 | 2006年7月 2006,07,00,,, | Extraction of Functionally Similar Bioinformatics Workflows | 共著 | Proceedings of Workshop on Distibuted Applications, Web Services,Tools and GRID Infrastructures for Bioinformatics (NETTAB 2006) | ||
189 | 学会発表7 | 2006年6月 2006,06,00,,, | Nucleotide Encoding according to Perfect Linear Code and its Application to Multiple Alignment | 単行本 | 共著 | 情報処理学会研究報告 バイオ情報学研究会 | 2006-BIO-5-18 |
190 | 論文1 | 2006年4月 2006,04,00,,, | A method for similarity search of genomic positional expression using CAGE | 学術雑誌 | 共著 | PLoS Genetics | ( 2 - 4 ), pp. 578-586 |
191 | 論文1 | 2006年4月 2006,04,00,,, | Transcript Annotation in FANTOM3: Mouse Gene Catalog Based on Physical cDNAs | 学術雑誌 | 共著 | PLoS Genetics | ( 2 - 4 ), pp.498-503 |
192 | 学会発表7 | 2006年3月 2006,03,00,,, | CAGEデータに基づく組織特異的な代謝反応パスウェイの抽出 | 単行本 | 共著 | 電子情報通信学会総合大会予稿集 | D-7-9 |
193 | 学会発表7 | 2006年3月 2006,03,00,,, | Webサービス統合環境実現のためのメディエータシステムの設計と実装 | 単行本 | 共著 | 電子情報通信学会総合大会予稿集 | D-4-16 |
194 | 学会発表7 | 2005年12月 2005,12,00,,, | 最大密度部分グラフ法を用いた高感度な機能部位の探索手法 | 単行本 | 共著 | 第28回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 2P-0021 |
195 | 学会発表7 | 2005年12月 2005,12,00,,, | タンパク質・化合物相互作用予測のための構造類似性を利用した化合物データベース情報統合手法 | 単行本 | 共著 | 第28回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 2P-0022 |
196 | 学会発表7 | 2005年12月 2005,12,00,,, | 部分構造の重みと組み合せを利用した類似化合物の探索手法 | 単行本 | 共著 | 第28回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 2P-0024 |
197 | 学会発表7 | 2005年12月 2005,12,00,,, | バイクラスタリングを利用した複数の発現データからの遺伝子制御ネットワーク推定手法 | 単行本 | 共著 | 第28回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 2P-0030 |
198 | 学会発表7 | 2005年12月 2005,12,00,,, | 異種性物間での発現比較によるオーソログ遺伝子の機能解析手法 | 単行本 | 共著 | 第28回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 2P-0047 |
199 | 学会発表7 | 2005年12月 2005,12,00,,, | メタデータを用いた分子生物学データベースの統合方式 | 単行本 | 共著 | 第28回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 2P-0075 |
200 | 論文1 | 2005年9月 2005,09,00,,, | The transcriptional landscape of the mammalian genome | 学術雑誌 | 共著 | Science | ( 309 - 5740 ), pp.1559-1563 |
201 | 国際学会8 | 2005年5月 2005,05,00,,, | A Framework for Biological Analysis on the Grid | 共著 | Proceedings of Lifescience Grid Workshop | ||
202 | 学会発表7 | 2005年4月 2005,04,00,,, | 遺伝子発現プロファイル解析のためのクラスタリングアルゴリズムの提案とFPGAへの実装 | 単行本 | 共著 | 第18回回路とシステム軽井沢ワークショップ論文集 | pp.187-192 |
203 | 国際学会8 | 2004年12月 2004,12,00,,, | A Method for Clustering Expression Data Based on Graph Structure | 学術雑誌 | 共著 | Genome Informatics | Vol.15, No.2, pp.151-160 |
204 | 学会発表7 | 2004年12月 2004,12,00,,, | Evolutionary Trace法の結果を利用したタンパク質機能予測のための機能部位類似尺度 | 単行本 | 共著 | 第27回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 2PB-280 |
205 | 学会発表7 | 2004年12月 2004,12,00,,, | オーソログ遺伝子の発現類似性を利用した遺伝子機能類似性解析手法 | 単行本 | 共著 | 第27回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 2PB-392 |
206 | 学会発表7 | 2004年12月 2004,12,00,,, | 遺伝子発現プロファイル間の局所的類似性を考慮したクラスタリング手法 | 単行本 | 共著 | 第27回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 2PB-395 |
207 | 学会発表7 | 2004年12月 2004,12,00,,, | 遺伝子の共発現を考慮した遺伝子制御ネットワークの推定手法 | 単行本 | 共著 | 第27回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 2PB-402 |
208 | 学会発表7 | 2004年12月 2004,12,00,,, | Gene Ontologyを利用した遺伝子ネットワークの機能解析手法 | 単行本 | 共著 | 第27回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 2PB-416 |
209 | 学会発表7 | 2004年12月 2004,12,00,,, | 系統プロファイルを利用した代謝反応ネットワーク中のサブネットワーク抽出手法 | 単行本 | 共著 | 第27回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 2PB-417 |
210 | 学会発表7 | 2004年12月 2004,12,00,,, | 既知のタンパク質・化合物相互作用関係と構造比較による化合物の活性予測手法とタンパク質・化合物データ間の関連付けへの応用 | 単行本 | 共著 | 第27回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 2PB-423 |
211 | 学会発表7 | 2004年12月 2004,12,00,,, | タンパク質の機能分類データを用いたタンパク質・化合物相互作用検索システムの開発 | 単行本 | 共著 | 第27回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 2PB-424 |
212 | 学会発表7 | 2004年12月 2004,12,00,,, | 類似化合物探索のための構造類似性を利用した化合物集合の分類手法 | 単行本 | 共著 | 第27回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 2PB-425 |
213 | 学会発表7 | 2004年12月 2004,12,00,,, | 化合物の生物活性予測のための類似尺度と解析手法 | 単行本 | 共著 | 第27回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 2PB-426 |
214 | 学会発表7 | 2004年12月 2004,12,00,,, | 異種間の代謝ネットワーク構造の違いを考慮した遺伝子の必須性に関わる化合物の探索手法 | 単行本 | 共著 | 第27回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 2PB-422 |
215 | 論文1 | 2004年9月 2004,09,00,,, | 遺伝子の機能分類を利用した遺伝子制御ネットワーク推定手法 | 学術雑誌 | 共著 | 情報科学技術レターズ | 第3巻, pp.23-24 |
216 | 学会発表7 | 2004年9月 2004,09,00,,, | 遺伝子の機能分類を利用した遺伝子制御ネットワーク推定手法 | 単行本 | 共著 | 情報科学技術フォーラム(FIT 2004) | LA-008 |
217 | 国際学会8 | 2004年8月 2004,08,00,,, | Inference of gene regulatory network based on module network model with gene functional classifications | 単行本 | 共著 | Proc. 3rd IEEE Computer Society Bioinformatics Conference(CSB2004) | pp.632-633 |
218 | 国際学会8 | 2004年8月 2004,08,00,,, | A Graph Analysis Method to Detect Metabolic Sub-networks Based on Phylogenetic Profile | 単行本 | 共著 | Proc. 3rd IEEE Computer Society Bioinformatics Conference(CSB2004) | pp.634-635 |
219 | 論文1 | 2004年1月 2004,01,00,,, | Graph-based clustering for finding distant relationships in a large set of protein sequences | 学術雑誌 | 共著 | Bioinformatics | ( 20- 2 ), pp.243-252 |
220 | 国際学会8 | 2003年12月 2003,12,00,,, | Mapping of Artificial Nucleosome Positioning Sequences to the Saccharomyces cerevisiae Genome | 共著 | Genome Informatics | No.14, pp.462-463 | |
221 | 学会発表7 | 2003年12月 2003,12,00,,, | 遺伝子分類木の比較による遺伝子の持つ多様な特徴間の関連性抽出手法 | 単行本 | 共著 | 第26回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 1PA-049 |
222 | 学会発表7 | 2003年12月 2003,12,00,,, | 相対エントロピーとグラフ構造に基づく遺伝子発現プロファイルのクラスタリング手法 | 単行本 | 共著 | 第26回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 1PA-054 |
223 | 学会発表7 | 2003年12月 2003,12,00,,, | ネットワークの形状特性に基づく代謝反応パスウェイの分割手法 | 単行本 | 共著 | 第26回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 1PA-056 |
224 | 学会発表7 | 2003年12月 2003,12,00,,, | 化合物の生物活性予測のための物理化学特性の解析手法 | 単行本 | 共著 | 第26回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 1PA-058 |
225 | 学会発表7 | 2003年12月 2003,12,00,,, | 化合物構造の特徴比較によるタンパク質データベースと化合物データベースの連携手法 | 単行本 | 共著 | 第26回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 1PA-067 |
226 | 学会発表7 | 2003年12月 2003,12,00,,, | 必須遺伝子予測のための代謝反応パスウェイのネットワーク解析手法 | 単行本 | 共著 | 第26回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 3PA-053 |
227 | 学会発表7 | 2003年12月 2003,12,00,,, | 遺伝子発現プロファイルとGene Ontologyによる注釈情報を統合した遺伝子制御ネットワークの推定手法 | 単行本 | 共著 | 第26回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 3PA-054 |
228 | 国際学会8 | 2003年10月 2003,10,00,,, | A network analysis method by comparing microbial metabolic pathways | 共著 | Escherichia coli Conference Towards New Biology in the 21st Century | ||
229 | 学会発表7 | 2003年9月 2003,09,00,,, | 準完全グラフ構造に基づく遺伝子発現プロファイルの解析手法 | 単行本 | 共著 | 情報科学技術フォーラム(FIT 2003) | A-045 |
230 | 学会発表7 | 2003年9月 2003,09,00,,, | 生物学的知見を利用したModule Bayesian Networkによる遺伝子の制御ネットワークの推定 | 単行本 | 共著 | 情報処理学会研究報告数理モデル化と問題解決 | 03-MPS-46 |
231 | 国際学会8 | 2003年7月 2003,07,00,,, | P-Quasi Complete Linkage Clustering Method for Gene-Expression Profiles based on Distribution Analysis | 共著 | 11th International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology | B-59 | |
232 | 国際学会8 | 2003年7月 2003,07,00,,, | Frequency enumeration of DNA subsequences from large-scale sequences using linear cod | 共著 | 11th International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology | I-19 | |
233 | 論文1 | 2003年6月 2003,06,00,,, | Analysis of gene expression profiles based on clustering | 学術雑誌 | 共著 | Genome Research | ( 13 - 6b ), p.1558 |
234 | 国際学会8 | 2003年3月 2003,03,00,,, | A clustering method for comparative analysis between Genomes and Pathways | 単行本 | 共著 | 8th International Conference on Database Systems for Advanced Applications (DASFAA 2003) | pp. 327-334 |
235 | 論文1 | 2003年1月 2003,01,00,,, | Shortening the Computational time of the fluorescent DNA computing | 学術雑誌 | 共著 | Lecture Note in Computer Science | ( 2568 ), pp.85-94 |
236 | 論文1 | 2002年12月 2002,12,00,,, | Analysis of the mouse transcriptome based upon functional annotation of 60,770 full length cDNAs | 学術雑誌 | 共著 | Nature | ( 420 ) pp. 563-73 |
237 | 学会発表7 | 2002年12月 2002,12,00,,, | 代謝反応パスウェイ中の類似反応パターンとゲノムとの比較手法 | 単行本 | 共著 | 第25回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 1P-0043 |
238 | 学会発表7 | 2002年12月 2002,12,00,,, | ゲノム比較によるゲノム間の共通保存領域の検出手法 | 単行本 | 共著 | 第25回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 1P-0138 |
239 | 学会発表7 | 2002年12月 2002,12,00,,, | グラフ構造に基づく遺伝子発現プロファイルのクラスタリング手法 | 単行本 | 共著 | 第25回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 1P-0141 |
240 | 学会発表7 | 2002年12月 2002,12,00,,, | 遺伝子の配列と発現プロファイルのクラスタリング結果の比較手法 | 単行本 | 共著 | 第25回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 1P-0142 |
241 | 学会発表7 | 2002年12月 2002,12,00,,, | 発現プロファイルからの遺伝子機能予測のためのデータマイニング手法 | 単行本 | 共著 | 第25回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 1P-0143 |
242 | 学会発表7 | 2002年12月 2002,12,00,,, | 大量タンパク質配列データからの共通保存領域の検出手法 | 単行本 | 共著 | 第25回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 1P-0163 |
243 | 学会発表7 | 2002年12月 2002,12,00,,, | XMLによるタンパク質の機能情報の統合的表現とその利用 | 単行本 | 共著 | 第25回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 1P-0164 |
244 | 論文1 | 2002年9月 2002,09,00,,, | A proposal of DNA computing on beads with application to SAT problems | 学術雑誌 | 共著 | Lecture Note in Computer Science | ( 2340 ), pp.182-190 |
245 | 国際学会8 | 2002年6月 2002,06,00,,, | Shortening the computational time of the fluorescent DNA computing | 単行本 | 共著 | Eighth International Meeting on DNA computers (DNA8) | pp. 51-60 |
246 | 国際学会8 | 2002年5月 2002,05,00,,, | An analog algorithm for satisfiability problem | 単行本 | 共著 | Fifth International Symposium on Theory and Applications of Satisfiability Testing (SAT2002) | pp. 70-77 |
247 | 国際学会8 | 2002年5月 2002,05,00,,, | DNA computing by competitive hybridization for maximum satisfiability problem | 単行本 | 共著 | The 2002 IEEE world congress on computational intelligence, Congress on Evolutionary Computation (CEC2002) | pp. 472-476 |
248 | 国際学会8 | 2002年4月 2002,04,00,,, | Analysis of gene expression profiles based on clustering | 共著 | Functional annotation of mouse 2 (FANTOM2) Cherry Blossom meeting | ||
249 | 学会発表7 | 2001年12月 2001,12,00,,, | 特徴選択を考慮した遺伝子発現プロファイルのクラスタリング | 単行本 | 共著 | 第24回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 2P-064 |
250 | 学会発表7 | 2001年12月 2001,12,00,,, | 遺伝子発現プロファイル解析のための分類木比較アルゴリズム | 単行本 | 共著 | 第24回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 2P-068 |
251 | 論文1 | 2001年9月 2001,09,00,,, | Relaxation of coefficient sensitiveness to performance for neural networks using neuron filter through total coloring problems | 学術雑誌 | 共著 | IEICE Transactions of Fundamentals | ( E84-A・No.9 ), pp.2367-2370 |
252 | 国際学会8 | 2001年6月 2001,06,00,,, | A proposal of DNA computing on beads and its application to SAT problems | 単行本 | 共著 | Seventh International Meeting on DNA computers (DNA7) | pp. 331-339 |
253 | 学会発表7 | 2001年3月 2001,03,00,,, | 主成分分析を用いた遺伝子発現データ検索結果の出力手法について | 単行本 | 共著 | 電子情報通信学会第12回データ工学ワークショップ論文集 (DEWS2001) | 4A-6 |
254 | 学会発表7 | 2001年3月 2001,03,00,,, | 遺伝子発現データのクラスタリング検索を行うXMLデータベースの構築 | 単行本 | 共著 | 電子情報通信学会第12回データ工学ワークショップ論文集 (DEWS2001) | 5A-1 |
255 | 学会発表7 | 2000年12月 2000,12,00,,, | 配列集合からの共通保存領域検出のためのクラスタリング手法 | 単行本 | 共著 | 第23回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 4PA-014 |
256 | 学会発表7 | 2000年12月 2000,12,00,,, | 統計的スコアに基づく局所マルチプルアライメントアルゴリズム | 単行本 | 共著 | 第23回日本分子生物学会年会講演予稿集 | 4PA-015 |
257 | 論文1 | 2000年9月 2000,09,00,,, | A proposal of neuron filter: a constraint resolution scheme of neural networks for combinatorial optimization problems | 学術雑誌 | 共著 | IEICE Transactions of Fundamentals | (E83-A・9 ), pp.1815-1823 |
258 | 国際学会8 | 2000年7月 2000,07,00,,, | A proposal of neuron filter algorithm with a thinning-out method for total coloring problems | 単行本 | 共著 | Proc. 4th world multi conference of Systemics, Cybernetics and Informatics (SCI2000) | pp. 563-568 |
259 | 国際学会8 | 1999年7月 1999,07,00,,, | A non-feedback neuron filter algorithm for separated board-level routing problems in FPGA-based logic emulation systems | 単行本 | 共著 | Proceedings of IEEE International Joint Conference on Neural Networks (IJCNN'99) | Jcnn0550.pdf |
260 | 国際学会8 | 1999年7月 1999,07,00,,, | A gradual neural network approach for broadcast scheduling in packet radio networks | 単行本 | 共著 | Proceedings of IEEE International Joint Conference on Neural Networks (IJCNN'99) | Jcnn0551.pdf |
261 | 論文1 | 1999年5月 1999,05,00,,, | チャネル割当問題を対象とした拡張マキシマムニューラルネットワーク解法の提案 | 学術雑誌 | 共著 | 電子情報通信学会和文論文誌A | 第82巻8号, pp. 683-690 |
262 | 学会発表7 | 1998年12月 1998,12,00,,, | A neuron filter algorithm for board-level routing problems in FPGA-based logic emulationsystems | 学術雑誌 | 共著 | 信学技報 | NLP98-87, pp. 23-29 |
263 | 国際学会8 | 1998年10月 1998,10,00,,, | An improved genetic algorithm using the Convex Hull for traveling salesman problem | 単行本 | 共著 | Proceedings of IEEE International Conference on Systems, Man, and Cybernetics (SMC'98) | pp. 2279-2284 |
264 | 学会発表7 | 1998年3月 1998,03,00,,, | セルラー通信網のあるチャネル割当問題に対するマキシマムニューラルネットワーク開放の提案 | 学術雑誌 | 共著 | 信学技報 | NLP97-172, pp. 85-92 |
265 | 学会発表7 | 1998年1月 1998,01,00,,, | 巡回セールスマン問題の遺伝的アルゴリズムに対する凸包の応用 | 学術雑誌 | 共著 | 信学技報 | SS97-48, pp.17-24 |
266 | 論文1 | 1997年11月 1997,11,00,,, | N-Queen問題を対象としたマキシマムニューロンモデルの競合解消方式の提案 | 学術雑誌 | 共著 | 情報処理学会論文誌 | 第38巻11号,pp. 2142-2148 |
267 | 論文1 | 1997年6月 1997,06,00,,, | A maximum neural network approach for N-Queen problems. | 学術雑誌 | 共著 | Biological Cybernetics | (76), pp. 251-255 |
268 | 国際学会8 | 1997年6月 1997,06,00,,, | A proposal of neuron mask in neural network algorithm for combinatorial optimization problems | 単行本 | 共著 | Proceedings of IEEE International Conference on Neural Networks (ICNN'97) | Vol.2, pp. 1289-1294 |
269 | 学会発表7 | 1997年3月 1997,03,00,,, | 巡回セールスマン問題を対象としたニューロンフィルタの提案 | 学術雑誌 | 共著 | 信学技報 | NC96-150, pp. 287-294 |
270 | 学会発表7 | 1996年11月 1996,11,00,,, | N-Queen問題を対象としたマキシマムニューロンモデルのWinner-take-all方式に関する研究 | 学術雑誌 | 共著 | 信学技報 | SS96-26, pp. 25-32 |
271 | 論文1 | 1996年10月 1996,10,00,,, | マキシマムニューロンを用いたN-Queen問題のニューラルネットワーク解法の提案 | 学術雑誌 | 共著 | 情報処理学会誌 | 第37巻10号,pp. 1788-1791 |
272 | 学会発表7 | 1996年1月 1996,01,00,,, | マキシマムニューロンを用いたN-Queen問題の準同期並列解法の提案 | 学術雑誌 | 共著 | 信学技報 | COMP95-81, pp. 77-84 |
273 | 国際学会8 | ,,,,, | A Method for the Inference of Gene Regulatory Networks based on Dynamic Bayesian Network with Clustering of Time-Series Subsequences | 共著 | Proceedings of the 20th International Conference on Genome Informatics (GIW2009) | P080 |
学会発表Quantify the Effect of Genetic Factors on DNA Methylation using Identical Twins査読有その他共著Yoichi Takenaka;Mikio Watanabeproceedings of IIBMP2022O1-32022年9月 13日~2022年9月 13日IIBMP2022Osaka, JapanObservable characteristics result from two essential factors: genetics and environment. The genomic DNA sequence remains unchanged throughout life, but methyl groups are added or removed depending on these factors. Thus, the methylated genome alters the activity of the genes.
We proposed an index to quantify the effects of genetic and environmental factors on DNA methylation using identical twins.
The index reveals that environmental factors have a more substantial impact on varying methylation levels.
We verified the relationship between disorders and the methylation sites under the strong influence of genetic factors selected by our measurement. The associations between genes and disorders were from MalaCards. The seven of ten genes under the strongest influence on genetic factors were associated with known disorders, which was statistically significant. The result indicates that methylation sites susceptible to genetic factors were significantly associated with disorders.
We expect our measurement to quantify genetic factors’ effect on DNA methylation sites to help identify causative genes for various diseases.
国際学会The legislative study on Meiji civil code by machine learning査読有その他共著kaito Koyama;Tomoya Sano;Yoichi TakenakaProceedings of Fifteenth International Workshop on Juris-informatics (JURISIN 2021)2021年11月 14日~2021年11月 15日Fifteenth International Workshop on Juris-informatics (JURISIN 2021)onlineEnglish
国際学会Rotational weight update in full-connection layers exceeds dropout in image recognition tasks査読有学術雑誌共著Tetsuya Hori;Yuki Sekiya,;Yoichi TakenakaProceedings of 2nd International Conference on Deep Learning Theory and Applications2021年7月 7日~2021年7月 9日onlineEnglish
講演計算機による法条文の自然言語解析その他共著竹中 要一;佐野 智也2020年11月 26日~2020年11月 26日法とコンピュータ学会第二回小グループ研究会オンライン我々が用いている言葉を計算機で解析する事を自然言語解析と呼ぶ。我々が日常的に使用しているグーグル検索も自然言語解析の一例である。本日は明治民法を解析対象とした研究を紹介する。現行民法は1896年(明治29年)に制定され、その後多数の改正を経てきた。明治民法とは、制定当時の民法の事である。
穂積陳重・富井政章・梅謙次郎の3名が起草した明治民法は、不平等条約の解消を一目的としており、フランスをはじめとする西洋各国の法令を参考にしたと言われている。この事柄を、計算機により明治民法の各条と西洋各国民法の各条を網羅的かつ客観的に解析する事で、再確認するとともに、新たな知見を得る切掛として有効である事を示す。
自然言語解析の対象は明治民法に留まるわけではない。 1) 全都道府県の全例規比較、2) 大阪府議会議事録の計算機解析 3) 最高裁判例(刑事)の参照法解析と判事評価 についても、時間の許す範囲で紹介する。
学会発表CNNの画像分類タスクにおけるRotational-Updateの検証査読無その他国内共著竹中 要一;堀 哲也;関谷 侑希第23回情報論的学術理論ワークショップ(IBIS2020)発表番号212020年11月 26日~2020年11月 26日第23回情報論的学術理論ワークショップ(IBIS2020)オンライン
学会発表深層学習の逆伝播における全結合層ニューロンの準同期式更新査読無学術雑誌共著竹中 要一;堀 智也;関谷 侑希FIT2020 第19回情報科学技術フォーラム講演論文集CG-0032020年9月 1日~2020年9月 1日電子情報通信学会・情報処理学会オンライン
講演機械学習による明治民法と参照立法例の関係分析査読無竹中 要一2020年8月 22日~2020年8月 22日第5回 民法史研究会
学会発表分散ベクトルに基づく文書のアライメント -AKB48の歌詞の類似性解析-査読無学術雑誌単著竹中 要一言語処理学会第26回大会予稿集D3-12020年3月 18日~2020年3月 18日言語処理学会オンライン
学会発表地方議会議事録にもとづく議会発言特徴の抽出査読無学術雑誌共著竹中 要一;名取 良太;大住 恭平言語処理学会第27回年次大会予稿集P-1-92020年3月 17日~2020年3月 17日言語処理学会オンライン
学会発表明治民法と各国民法との条文類似関係にもとづく立脚点の解析査読無その他共著竹中 要一;小山 凱丈;佐野 智也言語処理学会第27回年次大会予稿集P-1-242020年3月 17日~2020年3月 17日言語処理学会オンライン
学会発表情報論的学習理論ワークショップ査読無その他共著竹中 要一;堀 智也2Q3-J-2-052019年11月 20日~2019年11月 20日情報論的学習理論ワークショップ愛知県名古屋市
論文Chromatin 3D reconstruction from chromosomal contacts using a genetic algorithm査読有学術雑誌国際共著Viacheslav Kapilevich;Shigeto Seno;Hideo Matsuda;Yoichi TakenakaIEEE/ACM Transactions on Computational Biology and BioinformaticsVol.17, Issue 52019年10月 ~2019年10月 DOI: 10.1109/TCBB.2018.2814995
学会発表畳み込みニューラルネットワークの学習過程の可視化坂井 創一;竹中 要一2Q3-J-2-052019年6月 5日~2019年6月 5日人工知能学会全国大会(第33回)新潟
学会発表回帰における多重共線性の全整数最適化アプローチ査読無仲川勇二;花田良子;竹中要一;岩田員典2-B-102019年3月 15日~2019年3月 15日日本オペレーションズ・リサーチ学会 2019年 春季研究発表会千葉工業大学
学会発表明治民法制定時における日仏民法条文の参照関係再推定査読無小山凱丈;佐野智也;竹中要一P-1-242019年3月 14日~2019年3月 14日言語処理学会第25回年次大名古屋大学
国際学会Transition of regulatory force toward the gene expressions during osteoblast cell査読無単著Yoichi Takenaka2019年1月 5日~2019年1月 5日Pacific Symposium on Biocomputing (PSB) 2019HI, USA
学会発表TgAb出現が一致しない一卵性双生児ペアを対象とした、自己抗体出現に関するエピゲノム要因の解析渡邉幹夫;竹中要一;本多智佳;大阪ツインリサーチグループ;岩谷良則2018年11月 23日~2018年11月 23日第61回日本甲状腺学会学術集会川越
学会発表自己抗体の出現が一致しない一卵性双生児を対象とした、自己抗体出現に影響する遺伝要因とエピゲノム要因の解析渡邉幹夫;竹中要一;本多智佳;大阪ツインリサーチグループ;岩谷良則2018年11月 8日~2018年11月 8日第46回日本臨床免疫学会総会軽井沢
国際学会Nonconvex Discrete Optimization Approach for Highdimensional Regression査読無学術雑誌国際共著NAKAGAWA Yuji;HANADA Yoshiko;TAKENAKA,Youichi;Edirisinghe Chanaka2018年11月 7日~2018年11月 7日INFORMS annual meetingPhoenix, AZ, USAIn high-dimensional regression, where the number of explanatory variables is much larger than the sample size, a statistical problem known as the ‘curse of dimensionality’ arises. The strategy of performing all possible regressions is computationally-impractical. We model using non-convex discrete optimization to minimize MSE. We describe an application involving a large number of SNPs in genomic studies for cancer detection.
国際学会Nonconvex Discrete Optimization Approach for High Dimensional Regression査読無学術雑誌国際共著Nakagawa Y.;Hanada Y;Takenaka, Y.;Edirishinghe C.2018年11月 7日~2018年11月 7日INFORMS annual meeting 2018Phoenix, USA
国際学会Genotype-based epigenetic factors in identical twins discordant for positive TgAb査読無共著Mikio Watanabe;Yoichi Takenaka;Chika Honda;Osaka Twin Research Group;Yoshinori IwataniAACC Annual Meeting & Clinical Lab Expo 20182018年7月 31日~2018年7月 31日
学会発表自己抗体の出現が不一致な一卵性双生児における、個体の遺伝背景を考慮したDNAメチル化率の解析渡邉幹夫;竹中要一;本多智佳;大阪ツインリサーチグループ;岩谷良則2018年5月 24日~2018年5月 24日第12回日本エピジェネティクス研究会年会札幌
論文Automated transition analysis of activated gene regulation during diauxic nutrient shift in Escherichia coli and adipocyte differentiation in mouse cells査読有学術雑誌国内共著TAKENAKA,Yoichi;Kazuma Mikami;Shigeto Seno;Hideo Matsuda;BMC bioinformaticsvol 19(suppl 4):892018年5月 ~2018年5月 10.1186/s12859-018-2072-y
論文Collaborative environmental DNA sampling from petal surfaces of flowering cherry
Cerasus × yedoensis 'Somei-yoshino'査読有学術雑誌国内共著Tazro Ohta;et. al.;Yoichi Takenaka (16th in 23)Journal of Plant Research131(4) pp.709-1712018年2月 ~2018年2月 10.1007/s10265-018-1017-x
学会発表一卵性双生児を対象とした HbA1c 値に影響するゲノムおよびエピゲノム因子の探索尾崎律子;渡邉幹夫;竹中要一;本多智佳;富澤理恵;岩谷良則演題82018年1月 27日~2018年1月 27日日本双生児研究学会 第32回学術講演会大阪大学
国際学会Functional analysis of metagenome using composition- based method査読無共著Meya Cho;Shigeto Seno;Hideo Matsuda;Yoichi TakenakaThe 16th Asia Pacific Bioinformatics ConferenceA182018年1月 15日~2018年1月 17日
論文Diagnostic assessment of deep learning algorithms for detection of lymph node metastases in women with breast cancer査読有学術雑誌国際共著Babak Ehteshami Bejnordi;et. al.;Yoichi Takenaka (50th author among 61)The Journal of the American Medical AssociationVol.318, No.22, pp.2199-22102017年12月 ~2017年12月 10.1001/jama.2017.14585
学会発表一卵性双生児を対象としたHbA1c値に影響する遺伝因子と環境因子の探索尾崎律子;渡邉幹夫;竹中要一;本多智佳;富澤理恵;大阪ツインリサーチグループ;岩谷良則2017年10月 7日~2017年10月 7日57回日本臨床化学会年次学術集会札幌
学会発表蛍光顕微鏡画像のためのグラフカットによる毛細血管の抽出手法嶋田彩人;繁田浩功;瀬尾茂人;池田わたる;竹中要一;松田秀雄2017年8月 ~2017年8月 画像の認識・理解シンポジウム(MIRU2017)
学会発表お花見メタゲノムプロジェクト結果報告国内共著大田達郎;川島武士;土橋映仁;平岡聡史;星野辰彦;菅野圭一;片岡剛文;川島秀一;松井求;根本航;西嶋傑;菅沼名津季;鈴木治夫;田口善弘;竹中要一;谷川洋介;恒吉桃香;吉武和敏;荒川和晴;山下理宇;岩崎渉2017年5月 23日~2017年5月 24日NGS現場の会 第五回研究会仙台
学会発表一細胞解析のための潜在的ディリクレ配分法を用いた遺伝子群の機能予測手法査読無江藤充宏;瀬尾茂人;竹中要一;松田秀雄2017年5月 23日~2017年5月 24日NGS現場の会 第五回研究会仙台
学会発表細胞個体の移動傾向の違いを考慮したグローバルデータアソシエーションを用いた細胞追跡手法単行本共著伊藤 澄美;瀬尾 茂人;繁田 浩功;菊田順一;竹中要一;石井優;松田秀雄第112回数理モデル化と問題解決研究発表会2017-MPS-112-62017年2月
学会発表畳み込みニューラルネットワークを用いた脂肪細胞セグメンテーションにおける分割精度改善手法の提案単行本共著薮崎 隼人;瀬尾茂人;竹中要一(阪大);後藤 剛;河田 照雄(京大);松田 秀雄第112回数理モデル化と問題解決研究発表会2017-MPS-112-272017年2月
論文Genotype-based epigenetic differences in monozygotic twins discordant for positive anti-thyroglobulin autoantibodies査読有学術雑誌国内共著Mikio Watanabe;Yoichi Takenaka;Chika Honda;Yoshinori IwataniThyroid28(1), 110-1232017年1月 ~2017年1月
国際学会Comparative analysis of transformation methods for gene expression profiles in breast cancer datasets査読有単行本共著Yoshiaki Sota;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Shinzaburo Noguchi;Hideo MatsudaIEEE 16th International Conference on Bioinformatics and Bioengineering (BIBE 2016)pp.328-3332016年11月 1日Splendor Hotel, Taichung, Taiwan10.1109/BIBE.2016.51
国際学会An accurate estimation method for expression profiles of novel transcripts from RNA-Seq data,査読無共著Fuki Iwasaki;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaInternational Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2016)No.N242016年7月 Swan and Dolphin Hotel, Orlando, Florida, USA
国際学会A method for reducing false positives of target genes of microRNAs by combining two prediction tools査読無共著Hideo Matsuda;Junko Tsuda;Shigeto Seno;Yoichi TakenakaInternational Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2016),No.O492016年7月 Swan and Dolphin Hotel, Orlando, Florida, USA
学会発表オプティカルフローとウェーブレット解析を用いた白血球の動態の解析手法単行本共著松原周平;瀬尾茂人;西澤志乃;菊田順一;竹中要一;石井優;松田秀雄バイオイメージ・インフォマティクスワークショップ 2016P032016年6月 大阪大学銀杏会館, 大阪
学会発表画像処理とディープラーニングの手法を用いた病理診断支援単行本共著渡邊誓旅;瀬尾茂人;竹中要一;松田秀雄バイオイメージ・インフォマティクスワークショップ 2016P232016年6月 大阪大学銀杏会館, 大阪
国際学会Bayesian Network Inference from gene expression profiles with a small number of samples査読無共著Kazumasa Saito;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaThe 20th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology,RECOMB2016Poster-502016年4月
国際学会Dynamic Analysis of Gene Regulations using Leaving-One-Out Expression Profile,査読無共著Yoichi Takenaka;Shigeto Seno;Hideo MatsudaThe 20th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology, RECOMB2016Poster-482016年4月
論文Similarity Measure among Structures of Local Government Statute Books based on Tree Edit Distance査読有学術雑誌共著Yoichi Takenaka;Takeshi WakaoJournal of Open Access to LawVol. 4, No.12016年3月 10.1109/KSE.2015.57全14頁
学会発表オプティカルフローを用いた3次元生体イメージングデータからの細胞動態の解析共著藤代昂希;瀬尾茂人;竹中要一;古家雅之;菊田順一;石井優;松田秀雄第201回CVIM研究会2016年3月
学会発表コンポーネントツリーとデータアソシエーションを用いた細胞追跡手法単行本共著藏重 昂平;瀬尾茂人;竹中要一;松田秀雄第107回数理モデル化と問題解決研究発表会2016-MPS-107-62016年3月
学会発表Deep learningを用いた脂肪組織画像における細胞の認識単行本共著水野雄太;瀬尾茂人;渡邊誓旅;竹中要一;平松拓郎;後藤剛;河田照雄;松田秀雄第107回数理モデル化と問題解決研究発表会2016-MPS-107-102016年3月
学会発表小サンプル数データに対するベイジアンネットワークのスコアベース構造学習改善手法単行本共著齋藤和正;瀬尾茂人;竹中要一;松田秀雄第45回バイオ情報学研究発表会2016-BIO-45-12016年3月
学会発表乳癌データベースを用いた遺伝子発現プロファイルの数値変換の検討単行本共著草田義昭;瀬尾茂人;竹中要一;野口眞三郎;松田秀雄第45回バイオ情報学研究発表会2016-BIO-45-72016年3月
国際学会Identification of the state-change-time-point of gene regulations from time-course experiments査読無単著Yoichi TakenakaThe second workshop on Advanced Methodologies for Bayesian Networks2015年11月
国際学会Similarity Measure among Structures of Local Government Statute Books based on Tree Edit Distance査読有単行本共著Yoichi Takenaka;Takeshi WakaoThe 7th international conference on Knowledge and Systems Engineering (KSE 2015)No. 10, pp. 49-542015年10月
論文Detecting shifts in gene regulatory networks during time-course experiments at single-time-point temporal resolution査読有学術雑誌共著Yoichi Takenaka;Shigeto Seno;Hideo MatsudaJ. Bioinformatics and Computational Biologyvol. 13 Issue 52015年9月 10.1142/S0219720015430027全18頁
国際学会Detecting the shifts of gene regulatory networks during time-course experiments with a single time point temporal resolution査読有単行本共著Yoichi Takenaka;Shigeto Seno;Hideo MatsudaProceeding of GIW/InCoB2015J132015年9月
学会発表共通k-mer種別数に基づくメタゲノム分類手法共著吉田拓真;瀬尾茂人;竹中要一;松田秀雄第4回NGS現場の会2015年7月
学会発表風が吹くといつ桶屋は儲かるの? 遺伝子発現制御の時間変化解析単著竹中要一第4回NGS現場の会2015年7月
学会発表オプティカルフローを用いた血管中を遊走する白血球の動態の解析手法共著松原周平;瀬尾茂人;菊田順一;竹中要一;石井優;松田秀雄バイオイメージインフォマティクス・ワークショップ20152015年6月
学会発表コンポーネントツリーを用いたグローバルデータアソシエーションによる細胞追跡手法共著藏重 昂平;瀬尾茂人;間下以大;菊田順一;竹中要一;石井優;松田秀雄バイオイメージインフォマティクス・ワークショップ20152015年6月
学会発表ダイナミックベイジアンネットワークを用いた遺伝子制御ネットワーク推定の部分問題化による近似解法共著上木怜;瀬尾茂人;竹中要一;松田秀雄情報処理学会研究報告, 第42回バイオ情報学研究会2015年6月
論文都道府県の類似例規の抽出と応用査読有学術雑誌共著竹中要一;若尾岳志情報処理学会論文誌 数理モデル化と応用8巻・1号, pp.80-862015年3月
国際学会A rendering method based on local maximum intensity projection for in vivo cellular imaging査読有単行本共著Ryo Taguchi;Shigeto Seno;Junichi Kikuta;Yoichi Takenaka;Masaru Ishii;Hideo MatsudaProceedings of Medical and Biological Imaging - JSMBEJSMBE-MBI2014-22015年3月
学会発表木構造編集距離に基づく都道府県例規集構造の類似性評価単行本共著竹中要一;若尾岳志言語処理学会第21回年次大会C2-42015年3月
学会発表イベントヒストリー分析を用いたバイオイメージングデータの解析手法単行本共著瀬尾茂人;菊田順一;竹中要一;石井優;松田秀雄第37回日本分子生物学会年会3P-9622014年11月
国際学会An automatic event detection method using semi-supervised learning for time-lapse imaging data査読無共著Kojiro Fukuda;Shigeto Seno;Tomohiro Mashita;Yoichi Takenaka;Masaru Ishii;Hideo MatsudaBioimage Informatics 2014P222014年10月
国際学会Improvement approach of cell tracking accuracy by using inter-frame information査読無共著K. Kurashige;S. Seno;T. Mashita;J. Kikuta;Y. Takenaka;M. Ishii;H. MatsudaBioimage Informatics 2014P382014年10月
論文Metagenome fragment classification based on multiple motif-occurrence profiles査読有学術雑誌共著Naoki Matsushita;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaPeerJ( 2 : e559 )2014年9月 10.7717/peerj.559全13頁
学会発表大域データ対応付けの反復実行による細胞追跡精度の改善手法共著藏重 昂平;福田浩二郎;瀬尾茂人;間下以大;竹中要一;松田秀雄情報処理学会研究報告, 第39回バイオ情報学研究会2014年9月
学会発表リードの由来階級の既知・未知予測に基づくメタゲノム配列の系統分類手法共著吉田拓真;瀬尾茂人;竹中要一;松田秀雄情報処理学会研究報告, 第39回バイオ情報学研究会2014年9月
学会発表都道府県に共通する例規の抽出と応用単行本共著竹中要一;若尾岳志情報処理学会研究報告, 第100回数理モデル化と問題解決研究会2014-MPS-100-52014年9月
国際学会Chronological analysis of regulatory strength on gene regulatory networks査読無共著Yoichi Takenaka;Shigeto Seno;Hideo Matsuda13rd European Conference on Computational Biology ( ECCB2014 )B042014年7月
学会発表ベイジアンネットワークによる遺伝子制御ネットワーク推定結果の反復構築のための計算速度向上手法単行本共著津田絢子;瀬尾茂人;竹中要一;松田秀雄情報処理学会研究報告, 第98回数理モデル化と問題解決研究会2014-MPS-98-92014年6月
学会発表タイムラプスイメージングによる細胞周期観測画像の時空間解析共著福田浩二郎;瀬尾茂人;間下以大;竹中要一;松田秀雄バイオイメージ・インフォマティクスワークショップ 20142014年6月
学会発表マルチチャンネル蛍光顕微鏡動画のためのパーティクルフィルタを用いた細胞追跡手法単行本共著小森康祐;瀬尾茂人;間下以大;竹中要一;松田秀雄情報処理学会第76回全国大会5K-52014年3月
学会発表都道府県に共通する例規の自動抽出単行本共著竹中要一;若尾岳志言語処理学会第20回年次大会B6-42014年3月
論文複数時系列遺伝子発現プロファイルを利用した遺伝子制御ネットワーク推定の精度向上手法査読有学術雑誌共著渡邉之人;瀬尾茂人;竹中要一;松田秀雄情報処理学会論文誌 数理モデル化と応用Vol.6, No.3, pp.151-1622013年12月
論文混合正規分布モデルを用いた経時観測蛍光画像からの細胞核の検出と追跡手法査読有学術雑誌共著瀬尾茂人;間下以大;前田栄;竹中要一;石井優;松田秀雄情報処理学会論文誌 数理モデル化と応用Vol.6, No.3, pp.140-1502013年12月
学会発表時系列発現プロファイルを用いた時期特異的に機能するPPIサブネットワークの探索手法単行本共著荒木 嶺;瀬尾茂人;竹中要一;松田秀雄第36回日本分子生物学会年会2P-10532013年12月
国際学会Integrative prediction of miRNA-mRNA interactions from high-throughput sequencing data査読無共著Tomoshige Ohno;Shigeto Seno;Hiromi Daiyasu;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaRECOMB/ISCB Conference on Regulatory and Systems Genomics, with DREAM Challenges 20132013年11月
学会発表Estimation method of large-scale dynamic gene regulatory networks for cell differentiation by separation of time-course data単行本共著Tomoyoshi Nakayama;Hiromi Daiyasu;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo Matsuda2013年日本バイオインフォマティクス学会年会472013年10月
学会発表長いリードを計算機で扱うのに完全線形符号が効果的だと思うのです単行本共著竹中要一;瀬尾茂人;松田秀雄第三回NGS現場の会7-13-A2013年9月
学会発表RNA-seqデータを用いたDifferential Alternative Splicingの検出ツールの比較考察単行本共著河田愛明;竹中要一;瀬尾茂人;松田秀雄第三回NGS現場の会3-28-A2013年9月
学会発表多次元尺度構成法によるリード分類結果の視覚化単行本共著吉田拓真;竹中要一;瀬尾茂人;松田秀雄第三回NGS現場の会5-19-B2013年9月
学会発表経時観測蛍光画像からのモーションヒストリーイメージを用いた細胞分裂の検出方法単行本共著福田浩二郎;瀬尾茂人;間下以大;前田栄;竹中要一;石井優;松田秀雄第16回画像の認識・理解シンポジウム MIRU2013SS6-182013年8月
国際学会Reconstruction of Dynamic Gene Regulatory Networks for Cell Differentiation by Separation of Time-course Data査読有共著Tomoyoshi Nakayama;Hiromi Daiyasu;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaThe 2013 World Congress in Computer Science Computer Engineering and Applied Computing2013年7月
国際学会A Method of Sequence Analysis for High-Throughput Sequencer Data Based on Shifted Short Read Clustering査読有共著Kensuke Suzuki;Daisuke Ueta;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaThe 2013 World Congress in Computer Science Computer Engineering and Applied Computing2013年7月
国際学会Gene Set Enrichment Analysis for a Long Time Series Gene Expression Profile査読有共著Yuta Okuma;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaThe 2013 World Congress in Computer Science Computer Engineering and Applied Computing2013年7月
国際学会Gene Set Enrichment Analysis for Time-Series Gene Expression Profile査読無共著Yuta Okuma;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo Matsuda35th Annual International IEEE EMBS Conference, 2013 IEEE EMBC2013年7月 Short Papers, 3225
国際学会Multiplication of Motif Occurrence Profiles for Metagenome Fragment Classification査読無共著Naoki Matsushita;Hiromi Daiyasu;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo Matsuda35th Annual International IEEE EMBS Conference, 2013 IEEE EMBC2013年7月 Short Papers, 3055
学会発表Global Data Associationによる経時観察画像における破骨前駆細胞の自動追跡手法単行本共著尾野貴広;瀬尾茂人;間下以大;竹中要一;石井優;松田秀雄第16回画像の認識・理解シンポジウム MIRU2013SS3-372013年7月
論文An estimation method for a cellular-statespecific gene regulatory network along tree-structured gene expression profiles査読有学術雑誌共著Ryo Araki;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaGene(518), pp.17-25 2013年4月
学会発表Improvement of the Accuracy of Mapping by Composing Alleles単行本共著奥田華代;竹中要一;大野朋重;瀬尾茂人;松田秀雄情報処理学会 第75回全国大会IB-62013年3月
学会発表混合正規分布モデルを用いた経時観測蛍光画像からの細胞核の検出と追跡手法単行本共著瀬尾茂人;間下以大;前田栄;竹中要一;石井優;松田秀雄情報処理学会研究報告 第92回数理モデル化と問題解決2013-MPS-92,No. 52013年2月
学会発表複数時系列遺伝子発現プロファイルを利用した遺伝子制御ネットワーク推定の精度向上手法単行本共著渡邉之人;瀬尾茂人;竹中要一;松田秀雄情報処理学会研究報告 第92回数理モデル化と問題解決2013-MPS-92,No. 122013年2月
国際学会An estimation method for a cellular-state-specific gene regulatory network along tree-structured gene expression profiles査読有共著Ryo Araki;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProceedings of the 2012 International Conference on Genome Informatics (GIW2012)2012年12月
国際学会Estimate Dynamic Gene Regulatory Networks in Adipocyte Differentiation for Detecting Changes of Gene Regulations by Splitting Time Course Data査読無共著Tomoyoshi Nakayama;Yoshiyuki Kido;Hiromi Daiyasu;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaThe 23rd International Conference on Genome Informatics (GIW2012) 2012年12月
学会発表多色蛍光イメージングによる経時観測データのための細胞追跡手法共著瀬尾茂人;間下以大;前田栄;竹中要一;石井優;松田秀雄ビジョン技術の実利用ワークショップ(VIEW2012)2012年12月
学会発表An automatic cell-tracking method and spatiotemporal analysis for time-lapse multicolor fluorescent images of cell cycle 共著Shigeto Seno;Sakae Maeda;Yoichi Takenaka;Masaru Ishii;Hideo Matsuda第35回分子生物学会年会2012年12月
学会発表Measuring Transcript-Type Dependent Expression Levels of ncRNAs in RNA-Seq Analysis共著Tomoshige Ohno;Shigeto Seno;Hiromi Daiyasu;Yoichi Takenaka;Hideo Matsuda第35回分子生物学会年会2012年12月
学会発表A cell-tracking method for time-lapse multicolor fluorescent images単行本共著瀬尾茂人;間下以大;前田栄;竹中要一;石井優;松田秀雄バイオイメージ・インフォマティクス ワークショップ2012p.572012年11月
国際学会Transcript-Type Dependent Normalization of Expression Levels in RNA-Seq Data for Non-Coding RNA Analysis査読有共著Tomoshige Ohno;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaJoint Conference on Informatics is Biology, Medicine and Pharmacology2012年10月
国際学会Comparison of Gene Expressions measured by RNA-seq and Microarray for Transcriptome Analysis of Adipose Tissues査読有共著Masakazu Sugiyama;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaJoint Conference on Informatics is Biology, Medicine and Pharmacology2012年10月
国際学会Two-stage method to infer gene regulatory network utilizing Link Prediction査読有共著Sho Ohsuga;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaJoint Conference on Informatics is Biology, Medicine and Pharmacology2012年10月
国際学会Estimation of Dynamic Gene Regulatory Networks for Cell Differentiation by Splitting Time Course Data査読有共著Tomoyoshi Nakayama;Yoshiyuki Kido;Hiromi Daiyasu;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaJoint Conference on Informatics in Biology, Medicine and Pharmacology2012年10月
国際学会Bayes-based inference of gene regulatory network for multiple time series gene expression profile査読有共著Yukito Watanabe;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaJoint Conference on Informatics in Biology, Medicine and Pharmacology2012年10月
国際学会Automatic cell tracking for time-lapse fluorescent images of cell cycle査読有共著Shigeto Seno;Sakae Maeda;Tomohiro Mashita;Yoichi Takenaka;Masaru Ishii;Hideo MatsudaTowards Comprehensive Understanding of Immune Dynamism (TCUID 2012) 2012年10月
学会発表Two-stage method to infer gene regulatory network utilizing Link Prediction単行本共著Sho Ohsuga;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo Matsuda生命医薬情報学連合大会B73_1322012年10月
学会発表Comparison of Gene Expressions measured by RNA-seq and Microarray for Transcriptome Analysis of Adipose Tissues単行本共著Masakazu Sugiyama;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo Matsuda生命医薬情報学連合大会B72_1152012年10月
学会発表Transcript-Type Dependent Normalization of Expression Levels in RNA-Seq Data for Non-Coding RNA Analysis単行本共著Tomoshige Ohno;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo Matsuda生命医薬情報学連合大会B71_742012年10月
学会発表Bayes-based inference of gene regulatory network for multiple time series gene expression profile単行本共著Yukito Watanabe;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo Matsuda生命医薬情報学連合大会JSBi-29 (B70_29)2012年10月
論文地方自治体の例規比較に用いる条文対応表の作成支援査読有学術雑誌共著竹中要一;若尾岳志自然言語処理第19巻 第3号,pp193-2122012年9月
国際学会All the 1+3n one-mismatch sequences of n-mer DNA are involved in 22.2+0.00879n strings of Perfect Linear Code words on DNA査読無共著Yoichi Takenaka;Shigeto Seno;Hideo MatsudaInternational Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2012)U442012年7月
学会発表A Method for Isoform Prediction from RNA-Seq Data by Iterative Mapping単行本共著Tomoshige Ohno;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo Matsuda情報処理学会研究報告 第29回バイオ情報学研究発表会Vol.2012-BIO-29, No.13, pp.1-72012年6月
学会発表時系列発現プロファイルのための遺伝子機能グループ解析手法単行本共著大熊祐太;瀬尾茂人;竹中要一;松田秀雄情報処理学会研究報告 第29回バイオ情報学研究発表会Vol.2012-BIO-20, No.26, pp.141-1472012年6月
学会発表ゲノムマッピング: Burrows-Wheeler transformの次のアルゴリズム単著竹中要一NGS現場の会 第二回研究会2012年5月
論文A method for isoform prediction from RNA-Seq data by iterative mapping査読有学術雑誌共著Tomoshige Ohno;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaIPSJ Transactions on Bioinformatics( 5 ), pp.27-332012年4月
学会発表近隣リードを考慮したショートリードクラスタリングによる塩基配列構造の有向非循環グラフ表現単行本共著上田大介;瀬尾茂人;竹中要一;松田秀雄情報処理学会研究報告 第87回 数理モデル化と問題解決2012-MPS-87-272012年3月
論文An Estimation Method for Inference of Gene Regulatory Network Using Bayesian Network with Uniting of Partial Problems査読有学術雑誌共著Yukito Watanabe;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaBMC Genomics(13 - suppl. 1)2012年1月 10.1186/1471-2164-13-S1-S12全9頁
国際学会An Estimation Method for Inference of Gene Regulatory Network Using Bayesian Network with Uniting of Partial Problems査読有単行本共著Yukito Watanabe;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaThe tenth Asia Pacific Bioinformatics Conference (APBC2012)A3.12012年1月
論文Inference of S-system Models of Gene Regulatory Networks using Immune Algorithm査読有学術雑誌共著Tomoyoshi Nakayama;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaJournal of Bioinformatics and Computational Biology( 9 - suppl. 1)2011年12月 10.1142/S0219720011005768全12頁
国際学会Inference of S-system Models of Gene Regulatory Networks using Immune Algorithm査読有共著Tomoyoshi Nakayama;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProceedings of the 2011 International Conference on Genome Informatics (GIW2011)2011年12月
国際学会A random forest approach to the detection of a rare disease in the case control studies査読無共著Yoshimi Kawakami;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaThe 22nd International Conference on Genome Informatics (GIW 2011) 2011年12月
論文細胞分化クロストークのモデル化と細胞分化クロストーク遺伝子の推定手法査読有学術雑誌共著吉澤陽志;瀬尾茂人;竹中要一;松田秀雄情報処理学会論文誌 数理モデル化と応用(TOM) 第4巻・第4号, pp.59-68 2011年11月
論文Perfect Hamming code with a hash table for faster genome mapping査読有学術雑誌共著Yoichi Takenaka;Shigeto Seno;Hideo MatsudaBMC Genomics (12 - suppl. 3), S32011年11月 10.1186/1471-2164-12-S3-S8全11頁
国際学会Mutation-aware clustering with error correction for short-read genome mapping査読有単行本共著Daisuke Ueta;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaThe 2011 Joint Conference of CBI&JSBiJSBi-272011年11月
国際学会Perfect Hamming code with a hash table for faster genome mapping査読有単行本共著Yoichi Takenaka;Shigeto Seno;Hideo MatsudaAsia Pacific Bioinformatics Network's 10th InCoB - 1st ISCB Asia Joint Conference 20113.22011年11月
国際学会Network analysis for time-series expression profile using nested effects models査読無共著Tatsuya Kitaguchi;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaThe 2011 Joint Conference of CBI & JSBi,JSBi-492011年11月
国際学会Sequence determination and expression estimation of alleles from RNA-Seq data査読無共著Yoichi Takenaka;Tomoshige Ohno;Kayo Okuda;Shigeto Seno;Hideo MatsudaAsia Pacific Bioinformatics Network's 10th InCoB - 1st ISCB Asia Joint Conference 2011No.1382011年11月
国際学会Detect unique gene regulatory networks along dendrogram of cell differentiation査読無共著Ryo Araki;Tomoshige Ohno;Kayo Okuda;Shigeto Seno;Hideo MatsudaAsia Pacific Bioinformatics Network's 10th InCoB - 1st ISCB Asia Joint Conference 2011No. 1562011年11月
国際学会Perfect Hamming code with Burrow-Wheeler translation for genome mapping査読無共著Yoichi Takenaka;Shigeto Seno;Hideo MatsudaAsia Pacific Bioinformatics Network's 10th InCoB - 1st ISCB Asia Joint Conference 2011No. 1342011年11月
国際学会A Method for Inference of Gene Regulatory Network based on Bayesian Network with Uniting of Partial Problems査読無共著Yukito Watanabe;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProceedings of 19th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 10th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB2011)N132011年7月
国際学会A Directed Graphical Gaussian Model for Inferring Gene Regulatory Networks査読無共著Tomoshige Ohno;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProceedings of 19th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 10th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB2011),X162011年7月
国際学会Perfect Hamming Code as Hash key for Fast Genome Mapping査読無共著Yoichi Takenaka;Shigeto Seno;Hideo MatsudaProceedings of 19th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 10th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB2011)U222011年7月
国際学会Feature selection for specifying experimental conditions that activate gene transcriptions査読無共著Sho Ohsuga;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProceedings of 19th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 10th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB2011)M132011年7月
国際学会A method for risk prediction of a serious disease using rule-based analysis査読無共著Masakazu Sugiyama;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProceedings of 19th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 10th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB2011)N132011年7月
学会発表生物情報解析ワークフローのためのRESTサービスのSOAPサービス変換手法単行本共著池田成吾;木戸善之;瀬尾茂人;竹中要一;松田秀雄情報処理学会研究報告 第25回バイオ情報学研究発表会2011-BIO-25-92011年6月
学会発表細胞分化クロストークのモデル化と細胞分化クロストーク遺伝子の推定手法単行本共著吉澤陽志;瀬尾茂人;竹中要一;松田秀雄情報処理学会研究報告 数理モデル化と問題解決2010-MPS-82-102011年3月
学会発表地方自治体の例規比較に用いる条文対応表の自動生成単行本共著竹中要一;若尾岳志言語処理学会 第17回年次大会 発表論文集pp.520-523 (D2-5)2011年3月
国際学会An Improved RNA-Seq Analysis Method for Isoform Prediction by Iterative Mapping査読有単行本共著Tomoshige Ohno;Motokazu Ishikawa;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProceedings of the 2010 International Conference on Genome Informatics (GIW2010)No.82010年12月
国際学会Revealing regulatory relationships of crosstalk with multiple time-series gene expression profiles査読無共著Kiyoshi Yoshizawa;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProc. the 2010 Annual Conference of the Japanese Society for Bioinformatics (JSBi2010)P0172010年12月
国際学会A bootstrapping method of S-system model for estimating timeline gene regulatory networks査読無共著Tomoyoshi Nakayama;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProc. the 2010 Annual Conference of the Japanese Society for Bioinformatics (JSBi2010)P0272010年12月
国際学会A Metadata Management System for Composing Bioinformatics Workflows査読有単行本共著Takuya Ishibashi;Yoshiyuki Kido;Takanori Fukumoto;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProceedings of the 9th International Conference on Bioinformatics (InCoB2010)No.1872010年9月
国際学会An algorithm for fast exact search of chemical compounds by clustered data beforehand査読無共著Ly Nguyen;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProceedings of the 21st International Workshop on Combinatorial Algorithms2010年7月
国際学会A method for predicting compound-protein interactions using canonical correlational analysis査読無共著Takuya Hashimoto,;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProc. 18th Annual International Conference on Intelligent Sysmtes for Molecular Biology,M0152010年7月
国際学会A method for detecting structural variants from massive paired end genome sequences by mapping signatures査読無共著Daisuke Ueta;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProc. 18th Annual International Conference on Intelligent Sysmtes for Molecular Biology,U0412010年7月
国際学会An estimation method of S-system model of gene regulatory networks using immune algorithm査読無共著Tomoyoshi Nakayama;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProc. 18th Annual International Conference on Intelligent Sysmtes for Molecular BiologyX0602010年7月
論文Gene expression profile prospectively predicts peritoneal relapse after curative surgery of gastric cancer査読有学術雑誌共著Atsushi Takeno;Ichiro Takemasa;Shigeto Seno;(Yoichi Takenaka は17員数中13番目)Annals of Surgical Oncology ( 17 - 4 ), pp.1033-10422010年4月
論文Improved prediction method for protein interactions using both structural and functional characteristics of proteins査読有学術雑誌共著Tatsuya Yoshikawa;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaIPSJ Transactions on Bioinformatics ( 3 ), pp.10-232010年3月
学会発表An approach for efficient computational analysis of massive RNA-Seq data単行本共著石川 元一;瀬尾茂人;竹中要一;松田秀雄第32回日本分子生物学会年会(MBSJ2009)2P-00332010年3月
学会発表立体構造情報と機能情報によるタンパク質間相互作用予測法の改良単行本共著吉川達也;瀬尾茂人;竹中要一;松田秀雄情報処理学会研究報告 バイオ情報学研究会2009-BIO-20-12010年3月
学会発表立体構造情報と機能情報によるタンパク質間相互作用予測法の改良単行本共著グエン カム リー;瀬尾茂人;竹中要一;松田秀雄情報処理学会研究報告 バイオ情報学研究会2009-BIO-20-72010年3月
国際学会A Method for Efficient Execution of Bioinformatics Workflows査読有単行本共著Junya Seo;Yoshiyuki Kido;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaGenome Informatics (GIW2009)vol.23, pp.139-1482009年12月
国際学会A Method of Estimation of Crosstalk Genes with Multiple Time-Series Gene Expression Profiles査読無共著Kiyoshi Yoshizawa;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProceedings of the 20th International Conference on Genome Informatics (GIW2009)P0572009年12月
国際学会A Method for Extraction of the Active Compound Groups which Have Strong Relationship between Structure and Activity査読無共著Takahiro Kishimoto;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProceedings of the 20th International Conference on Genome Informatics (GIW2009)P1332009年12月
国際学会A Method for Inference of Gene Regulatory Networks based on Bayesian Network with Clustering of Time-Series Subsequences査読無共著Yuya Shuto;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProceedings of 17th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 8th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB2009)X672009年6月
国際学会A Method for Analyzing Gene Expression Profiles based on the Underlying Structures査読無共著Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProceedings of 17th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 8th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB2009)M212009年6月
論文The transcriptional network that controls growth arrest and differentiation in a human myeloid leukemia cell line査読有学術雑誌共著FANTOM Consortium;Harukazu Suzuki;(Yoichi Takenaka は160員数中121番目)Nature Genetics ( 41- 5 ), pp.553-5622009年4月
学会発表Webサービス情報の統合のためのレポジトリ連携手法の提案単行本共著野中崇史;瀬尾淳哉;木戸善之;瀬尾茂人;竹中要一;松田秀雄情報処理学会研究報告 バイオ情報学研究会2009-BIO-16-12009年3月
国際学会A Method for Making a New Reference Set of PDB Entries for Retrieving Protein 3D Structures with Structural Annotations査読有単行本共著Masahiko Hamada;Yoshiyuki Kido;Shigeto Seno;Hiromi Daiyasu;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProceedings of the 2008 Annual Conference of the Japanese Society for BioinformaticsP074/T022008年12月
国際学会A Method for Reducing Bounds of Compound Search by Dividing Structure Key査読有単行本共著Takashi Shimizu;Yoshiyuki Kido;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProceedings of the 2008 Annual Conference of the Japanese Society for BioinformaticsP077/T012008年12月
国際学会Architecture of an Efficient Data Transfer System and Manager for Genome-wide Analysis Workflows査読無共著Junya Seo;Yoshiyuki Kido;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaThe 3rd MEI International Symposium2008年12月
国際学会A Method for Analysis of Tissue-Specific Transcriptional Control Using Distributions of Transcription Starting Sites査読無共著Mitsuru Jikeya;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProceedings of the 2008 Annual Conference of the Japanese Society for BioinformaticsP0442008年12月
国際学会The Validity Evaluation of Gene Regulatory Network Motifs Based on Differential Equation Model査読無共著Reiji Ohsugi;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProceedings of the 2008 Annual Conference of the Japanese Society for BioinformaticsP0452008年12月
国際学会An Efficient Data Transfer on Workflows for Genome-wide Analysis査読無共著Junya Seo;Yoshiyuki Kido;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProceedings of the 2008 Annual Conference of the Japanese Society for BioinformaticsP0752008年12月
学会発表脂肪細胞・骨芽細胞分化における遺伝子制御ネットワークの推定単行本共著松田秀雄;竹中要一;水野洋介;瀬尾茂人;徳澤佳美;仲地豊;坊農秀雅;岡崎康司第31回日本分子生物学会・第81回日本生化学会大会合同大会講演予稿集4S8-22008年12月
学会発表構造キーの分割によるTanimoto係数を用いた化合物検索の計算範囲の絞り込み手法単行本共著清水隆史;木戸善之;瀬尾茂人;竹中要一;松田秀雄情報処理学会研究報告 バイオ情報学研究会2008-BIO-14-22008年9月
国際学会Tissue specificity measured by differences in information content between target tissue and whole tissue査読無共著Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProceedings of International Society for Computational Bilogy 2008A212008年7月
国際学会A Clustering Method for Expression Patterns of Transcription Starting Sites査読無共著Mitsuru Jikeya;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProceedings of International Society for Computational Bilogy 2008J292008年7月
国際学会A Data Transmission Method for Web Services in Bioinformatics Workflows査読無共著Junya Seo;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProceedings of International Society for Computational Biology 2008E362008年7月
国際学会A method for analysis of tissue-specific alternative transcripts using CAGE tags査読無共著Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProceedings of International Society for Computational Bilogy 2008J302008年7月
学会発表化合物フィンガープリントを用いた活性サブクラスの抽出手法共著岸本 貴大;瀬尾茂人;竹中要一;松田秀雄日本分子生物学会第8回春季シンポジウム2008年5月
学会発表CAGE発現プロファイルを用いた転写開始点の発現パターンのクラスタリング手法共著寺家谷 満;瀬尾茂人;竹中要一;松田秀雄日本分子生物学会第8回春季シンポジウム2008年5月
論文A Distributed-Processing System for Accelerating Biological Research using Data-Staging査読有学術雑誌共著Yoshiyuki Kido;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaIPSJ Transactions on Bioinformatics( 49 ), pp.58-642008年3月
論文A Combination Method of the Tanimoto Coefficient and Proximity Measure of Random Forest for Compound Activity Prediction査読有学術雑誌共著Gen Kawamura;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaIPSJ Transactions on Bioinformatics( 49 ), pp.46-572008年3月
学会発表A Combination method between Tanimoto coefficient and Proximity Measure of Random Forest for Compound Activity Prediction単行本共著河村 元;瀬尾茂人;竹中要一;松田秀雄情報処理学会研究報告 バイオ情報学研究会2008-BIO-12-62008年3月
学会発表Tanimoto係数の性質に基づく化合物の類似度検索の高速化手法単行本共著清水隆史;瀬尾茂人;竹中要一;松田秀雄情報処理学会研究報告 バイオ情報学研究会2008-BIO-12-72008年3月
国際学会GO based Tissue Specific Functions of Mouse using Countable Gene Expression Profiles査読有学術雑誌共著Yoichi Takenaka;Atsuko Matsumoto;Hideo MatsudaGenome InformaticsVol 19, pp.154-1652007年12月
国際学会A Method for Retrieving Functionally Similar Bioinformatics Workflows査読無共著Junya Seo;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProceedings of 2007 Annual Conference of Japanese Society for BioinformaticsP0112007年12月
学会発表グラフ構造を用いた組織特異的な選択的スプライシングの解析手法単行本共著瀬尾茂人;竹中要一;松田秀雄日本分子生物学会第30回大会1P-10482007年12月
学会発表TF-IDFフィルタリングによる機能的に類似した生物情報解析ワークフローの検索手法単行本共著瀬尾淳哉;瀬尾茂人;竹中要一;松田秀雄情報処理学会研究報告 バイオ情報学研究会2007-BIO-11-572007年12月
論文Tissue-Specific Functions based on Information Content of Gene Ontology using Cap Analysis Gene Expression査読有学術雑誌共著Sami Maekawa;Atsuko Matsumoto;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaMedical and Biological Engineering and Computing( 45 ), pp.1029-10362007年10月
学会発表生物情報解析ワークフローにおけるデータ転送経路の効率化単行本共著瀬尾淳哉;瀬尾茂人;竹中要一;松田秀雄日本ソフトウェア科学会第24回大会予稿集7A-12007年9月
論文Retrieving Functionally Similar Bioinformatics Workflows using TF-IDF Filtering査読有学術雑誌共著Junya Seo;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaIPSJ Transactions on Bioinformatics( 48 ), pp.20-292007年3月
学会発表絶対値発現量を用いた外れ値解析に基づく代謝反応パスウェイの抽出単行本共著迫岡洋輔;竹中要一;松田秀雄情報処理学会研究報告バイオ情報学研究会2007-BIO-8-42007年3月
学会発表反応分類番号を用いたパスウェイアライメントの提案単行本共著新免剛;瀬尾茂人;竹中要一;松田秀雄情報処理学会研究報告バイオ情報学研究会2007-BIO-8-62007年3月
学会発表バイオインフォマティクス解析におけるWebサービス統合利用のためのメタサービスの提案単行本共著小野圭亮;竹中要一;松田秀雄情報処理学会第69回全国大会予稿集2ZB-82007年3月
学会発表CAGEタグを用いたゲノム領域上の共通発現パターン探索手法単行本共著瀬尾茂人;竹中要一;松田秀雄分子生物学会2006フォーラム要旨集1P-0302006年12月
学会発表構造記述子の情報量に基づく類似活性化合物の探索手法単行本共著木村浩章;瀬尾茂人;竹中要一;松田秀雄日本薬学会 第34回構造活性相関シンポジウム, 講演要旨集KP222006年11月
論文遺伝子発現プロファイルを用いた遺伝子制御ネットワーク推定のためのバイクラスタリングの応用査読有学術雑誌共著瀧浩平;寺本礼仁;竹中要一;松田秀雄情報処理学会論文誌 数理モデル化と応用第47巻, No.SIG14, pp.118-1282006年10月
国際学会Inference of Transcriptional Regulatory Networks using CAGE Transcriptome Dataset of Mus musculus査読有共著Kohei Taki;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProceedings of World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering2006年8月
国際学会A Method for Exploring Tissue-Specific Functions based on Information Content of Gene Ontology Terms using CAGE Tags査読有共著Sami Maekawa;Atsuko Matsumoto;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProceedings of World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering2006年8月
国際学会Extraction of Functionally Similar Bioinformatics Workflows査読有共著Junya Seo;Shigeto Senoo;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProceedings of Workshop on Distibuted Applications, Web Services,Tools and GRID Infrastructures for Bioinformatics (NETTAB 2006)2006年7月
学会発表Nucleotide Encoding according to Perfect Linear Code and its Application to Multiple Alignment単行本共著Yoichi Takenaka;Masato Sakata;Hideo Matsuda情報処理学会研究報告 バイオ情報学研究会2006-BIO-5-182006年6月
論文A method for similarity search of genomic positional expression using CAGE査読有学術雑誌共著Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Chikatoshi Kai;Jun Kawai;Piero Carninci;Yoshihide HayashizakiPLoS Genetics ( 2 - 4 ), pp. 578-5862006年4月
論文Transcript Annotation in FANTOM3: Mouse Gene Catalog Based on Physical cDNAs査読有学術雑誌共著Maeda N, ;Kasukawa T, ;Oyama R, ;Gough J, ;Frith M, ;(Yoichi. Takenakaは34員数中26番目)PLoS Genetics( 2 - 4 ), pp.498-5032006年4月
学会発表CAGEデータに基づく組織特異的な代謝反応パスウェイの抽出単行本共著迫岡洋輔;瀬尾茂人;瀧浩平;竹中要一;松田秀雄電子情報通信学会総合大会予稿集D-7-92006年3月
学会発表Webサービス統合環境実現のためのメディエータシステムの設計と実装単行本共著小野圭亮;竹中要一;松田秀雄電子情報通信学会総合大会予稿集D-4-162006年3月
学会発表最大密度部分グラフ法を用いた高感度な機能部位の探索手法単行本共著佐藤卓也;竹中要一;松田秀雄第28回日本分子生物学会年会講演予稿集2P-00212005年12月
学会発表タンパク質・化合物相互作用予測のための構造類似性を利用した化合物データベース情報統合手法単行本共著山上恭廣;河村元;竹中要一;松田秀雄第28回日本分子生物学会年会講演予稿集2P-00222005年12月
学会発表部分構造の重みと組み合せを利用した類似化合物の探索手法単行本共著阪本洋司;河村元;竹中要一;松田秀雄第28回日本分子生物学会年会講演予稿集2P-00242005年12月
学会発表バイクラスタリングを利用した複数の発現データからの遺伝子制御ネットワーク推定手法単行本共著瀧浩平;竹中要一;松田秀雄第28回日本分子生物学会年会講演予稿集2P-00302005年12月
学会発表異種性物間での発現比較によるオーソログ遺伝子の機能解析手法単行本共著松岡弘樹;竹中要一;松田秀雄第28回日本分子生物学会年会講演予稿集2P-00472005年12月
学会発表メタデータを用いた分子生物学データベースの統合方式単行本共著ヴォ トゥイ;竹中要一;松田秀雄第28回日本分子生物学会年会講演予稿集2P-00752005年12月
論文The transcriptional landscape of the mammalian genome査読有学術雑誌共著Carninci P,;Kasukawa T,;Katayama S, ;Gough J,;(Yoichi. Takenakaは194員数中135番目)Science ( 309 - 5740 ), pp.1559-15632005年9月
国際学会A Framework for Biological Analysis on the Grid査読有共著Toshiyuki Okumura;Susumu Date;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProceedings of Lifescience Grid Workshop 2005年5月
学会発表遺伝子発現プロファイル解析のためのクラスタリングアルゴリズムの提案とFPGAへの実装単行本共著渡辺秀一;北道淳司;黒田研一;竹中要一第18回回路とシステム軽井沢ワークショップ論文集pp.187-1922005年4月
国際学会A Method for Clustering Expression Data Based on Graph Structure査読有学術雑誌共著Shigeto Seno;Reiji Teramoto;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaGenome InformaticsVol.15, No.2, pp.151-1602004年12月
学会発表Evolutionary Trace法の結果を利用したタンパク質機能予測のための機能部位類似尺度単行本共著佐藤卓也;竹中要一;松田秀雄第27回日本分子生物学会年会講演予稿集2PB-2802004年12月
学会発表オーソログ遺伝子の発現類似性を利用した遺伝子機能類似性解析手法単行本共著松岡弘樹;寺本礼仁;竹中要一;松田秀雄第27回日本分子生物学会年会講演予稿集2PB-3922004年12月
学会発表遺伝子発現プロファイル間の局所的類似性を考慮したクラスタリング手法単行本共著瀬尾茂人;寺本礼仁;竹中要一;松田秀雄第27回日本分子生物学会年会講演予稿集2PB-3952004年12月
学会発表遺伝子の共発現を考慮した遺伝子制御ネットワークの推定手法単行本共著瀧浩平;寺本礼仁;竹中要一;松田秀雄第27回日本分子生物学会年会講演予稿集2PB-4022004年12月
学会発表Gene Ontologyを利用した遺伝子ネットワークの機能解析手法単行本共著松野広一;寺本礼仁;竹中要一;松田秀雄第27回日本分子生物学会年会講演予稿集2PB-4162004年12月
学会発表系統プロファイルを利用した代謝反応ネットワーク中のサブネットワーク抽出手法単行本共著三宅晶子;竹中要一;松田秀雄第27回日本分子生物学会年会講演予稿集2PB-4172004年12月
学会発表既知のタンパク質・化合物相互作用関係と構造比較による化合物の活性予測手法とタンパク質・化合物データ間の関連付けへの応用単行本共著山上恭廣;河村元;竹中要一;松田秀雄第27回日本分子生物学会年会講演予稿集2PB-4232004年12月
学会発表タンパク質の機能分類データを用いたタンパク質・化合物相互作用検索システムの開発単行本共著Vo Thuy;竹中要一;松田秀雄第27回日本分子生物学会年会講演予稿集2PB-4242004年12月
学会発表類似化合物探索のための構造類似性を利用した化合物集合の分類手法単行本共著阪本洋司;寺本礼仁;竹中要一;松田秀雄第27回日本分子生物学会年会講演予稿集2PB-4252004年12月
学会発表化合物の生物活性予測のための類似尺度と解析手法単行本共著伊藤琢也;寺本礼仁;竹中要一;松田秀雄第27回日本分子生物学会年会講演予稿集2PB-4262004年12月
学会発表異種間の代謝ネットワーク構造の違いを考慮した遺伝子の必須性に関わる化合物の探索手法単行本共著田中直樹;三木健良;山本義弘;寺本礼仁;竹中要一;松田秀雄第27回日本分子生物学会年会講演予稿集2PB-4222004年12月
論文遺伝子の機能分類を利用した遺伝子制御ネットワーク推定手法査読有学術雑誌共著瀧浩平;寺本礼仁;竹中要一;松田秀雄情報科学技術レターズ第3巻, pp.23-24 2004年9月
学会発表遺伝子の機能分類を利用した遺伝子制御ネットワーク推定手法単行本共著瀧浩平;寺本礼仁;竹中要一;松田秀雄情報科学技術フォーラム(FIT 2004) LA-0082004年9月
国際学会Inference of gene regulatory network based on module network model with gene functional classifications査読有単行本共著Kohei Taki;Reiji Teramoto;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProc. 3rd IEEE Computer Society Bioinformatics Conference(CSB2004)pp.632-6332004年8月
国際学会A Graph Analysis Method to Detect Metabolic Sub-networks Based on Phylogenetic Profile査読有単行本共著Shoko Miyake;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProc. 3rd IEEE Computer Society Bioinformatics Conference(CSB2004)pp.634-6352004年8月
論文Graph-based clustering for finding distant relationships in a large set of protein sequences査読有学術雑誌共著Hideya Kawaji;Yoichi Takenaka;Hideo Matsuda;Akihiro HashimotoBioinformatics ( 20- 2 ), pp.243-2522004年1月
国際学会Mapping of Artificial Nucleosome Positioning Sequences to the Saccharomyces cerevisiae Genome査読無共著Vorathaya Tantoolvesm;Yoichi Takenaka;Satoshi Harashima,;Hideo MatsudaGenome InformaticsNo.14, pp.462-4632003年12月
学会発表遺伝子分類木の比較による遺伝子の持つ多様な特徴間の関連性抽出手法単行本共著松野広一;寺本礼仁;竹中要一;松田秀雄第26回日本分子生物学会年会講演予稿集1PA-0492003年12月
学会発表相対エントロピーとグラフ構造に基づく遺伝子発現プロファイルのクラスタリング手法単行本共著瀬尾茂人;寺本礼仁;竹中要一;松田秀雄第26回日本分子生物学会年会講演予稿集1PA-0542003年12月
学会発表ネットワークの形状特性に基づく代謝反応パスウェイの分割手法単行本共著三宅晶子;竹中要一;松田秀雄第26回日本分子生物学会年会講演予稿集1PA-0562003年12月
学会発表化合物の生物活性予測のための物理化学特性の解析手法単行本共著伊藤琢也;寺本礼仁;竹中要一;松田秀雄第26回日本分子生物学会年会講演予稿集1PA-0582003年12月
学会発表化合物構造の特徴比較によるタンパク質データベースと化合物データベースの連携手法単行本共著太田浩康;寺本礼仁;竹中要一;松田秀雄第26回日本分子生物学会年会講演予稿集1PA-0672003年12月
学会発表必須遺伝子予測のための代謝反応パスウェイのネットワーク解析手法単行本共著田中直樹;三木健良;山本義弘;竹中要一;松田秀雄第26回日本分子生物学会年会講演予稿集3PA-0532003年12月
学会発表遺伝子発現プロファイルとGene Ontologyによる注釈情報を統合した遺伝子制御ネットワークの推定手法単行本共著瀧浩平;竹中要一;松田秀雄第26回日本分子生物学会年会講演予稿集3PA-0542003年12月
国際学会A network analysis method by comparing microbial metabolic pathways査読無共著Shoko Miyake;Yukako Tohsato,;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaEscherichia coli Conference Towards New Biology in the 21st Century2003年10月
学会発表準完全グラフ構造に基づく遺伝子発現プロファイルの解析手法単行本共著瀬尾茂人;寺本礼仁;竹中要一;松田秀雄情報科学技術フォーラム(FIT 2003)A-0452003年9月
学会発表生物学的知見を利用したModule Bayesian Networkによる遺伝子の制御ネットワークの推定単行本共著瀧浩平;竹中要一;松田秀雄情報処理学会研究報告数理モデル化と問題解決03-MPS-462003年9月
国際学会P-Quasi Complete Linkage Clustering Method for Gene-Expression Profiles based on Distribution Analysis査読無共著Shigeto Seno;Reiji Teramoto;Yoichi Takenaka;Hideo Matsuda11th International Conference on Intelligent Systems for Molecular BiologyB-592003年7月
国際学会Frequency enumeration of DNA subsequences from large-scale sequences using linear cod査読無共著Yoichi Takenaka;Hideo Matsuda11th International Conference on Intelligent Systems for Molecular BiologyI-192003年7月
論文Analysis of gene expression profiles based on clustering査読有学術雑誌共著Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaGenome Research( 13 - 6b ), p.15582003年6月
国際学会A clustering method for comparative analysis between Genomes and Pathways査読有単行本共著Shoko Miyake;Yukako Tohsato;Yoichi Takenaka;Hideo Matsuda8th International Conference on Database Systems for Advanced Applications (DASFAA 2003)pp. 327-3342003年3月
論文Shortening the Computational time of the fluorescent DNA computing査読有学術雑誌共著Takenaka Yoichi;Hashimoto AkihiroLecture Note in Computer Science ( 2568 ), pp.85-942003年1月
論文Analysis of the mouse transcriptome based upon functional annotation of 60,770 full length cDNAs査読有学術雑誌共著Yoichi Takenaka;(Yoichi Takenakaは員数131中88番目)Nature( 420 ) pp. 563-732002年12月
学会発表代謝反応パスウェイ中の類似反応パターンとゲノムとの比較手法単行本共著三宅晶子;遠里由佳子;竹中要一;松田秀雄第25回日本分子生物学会年会講演予稿集1P-00432002年12月
学会発表ゲノム比較によるゲノム間の共通保存領域の検出手法単行本共著小西幸雄;竹中要一;松田秀雄第25回日本分子生物学会年会講演予稿集1P-01382002年12月
学会発表グラフ構造に基づく遺伝子発現プロファイルのクラスタリング手法単行本共著瀬尾茂人;寺本礼仁;竹中要一;松田秀雄第25回日本分子生物学会年会講演予稿集1P-01412002年12月
学会発表遺伝子の配列と発現プロファイルのクラスタリング結果の比較手法単行本共著大塚亮平;竹中要一;松田秀雄第25回日本分子生物学会年会講演予稿集1P-01422002年12月
学会発表発現プロファイルからの遺伝子機能予測のためのデータマイニング手法単行本共著菅靖彦;竹中要一;松田秀雄第25回日本分子生物学会年会講演予稿集1P-01432002年12月
学会発表大量タンパク質配列データからの共通保存領域の検出手法単行本共著北山育;竹中要一;松田秀雄第25回日本分子生物学会年会講演予稿集1P-01632002年12月
学会発表XMLによるタンパク質の機能情報の統合的表現とその利用単行本共著西條竜太郎;竹中要一;松田秀雄第25回日本分子生物学会年会講演予稿集1P-01642002年12月
論文A proposal of DNA computing on beads with application to SAT problems査読有学術雑誌共著Takenaka Yoichi;Hashimoto AkihiroLecture Note in Computer Science( 2340 ), pp.182-1902002年9月
国際学会Shortening the computational time of the fluorescent DNA computing査読有単行本共著Takenaka Yoichi;Hashimoto AkihiroEighth International Meeting on DNA computers (DNA8)pp. 51-602002年6月
国際学会An analog algorithm for satisfiability problem査読有単行本共著Yoichi Takenaka;Akihiro HashimotoFifth International Symposium on Theory and Applications of Satisfiability Testing (SAT2002)pp. 70-772002年5月
国際学会DNA computing by competitive hybridization for maximum satisfiability problem査読有単行本共著Yoichi Takenaka;Akihiro HashimotoThe 2002 IEEE world congress on computational intelligence, Congress on Evolutionary Computation (CEC2002)pp. 472-4762002年5月
国際学会Analysis of gene expression profiles based on clustering査読無共著Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaFunctional annotation of mouse 2 (FANTOM2) Cherry Blossom meeting2002年4月
学会発表特徴選択を考慮した遺伝子発現プロファイルのクラスタリング単行本共著山脇晋吾;竹中要一;松田秀雄;橋本昭洋第24回日本分子生物学会年会講演予稿集2P-0642001年12月
学会発表遺伝子発現プロファイル解析のための分類木比較アルゴリズム単行本共著坊垣恭右;竹中要一;松田秀雄;橋本昭洋第24回日本分子生物学会年会講演予稿集2P-0682001年12月
論文Relaxation of coefficient sensitiveness to performance for neural networks using neuron filter through total coloring problems査読有学術雑誌共著Takenaka Yoichi;Funabiki Nobuo;Higashino TeruoIEICE Transactions of Fundamentals ( E84-A・No.9 ), pp.2367-23702001年9月
国際学会A proposal of DNA computing on beads and its application to SAT problems査読有単行本共著Takenaka Yoichi;Hashimoto AkihiroSeventh International Meeting on DNA computers (DNA7)pp. 331-3392001年6月
学会発表主成分分析を用いた遺伝子発現データ検索結果の出力手法について単行本共著山脇晋吾;廣中大雅;竹中要一;松田秀雄;橋本昭洋電子情報通信学会第12回データ工学ワークショップ論文集 (DEWS2001)4A-62001年3月
学会発表遺伝子発現データのクラスタリング検索を行うXMLデータベースの構築単行本共著坊垣恭右;増山智久;竹中要一;松田秀雄;橋本昭洋電子情報通信学会第12回データ工学ワークショップ論文集 (DEWS2001)5A-12001年3月
学会発表配列集合からの共通保存領域検出のためのクラスタリング手法単行本共著山口陽介;長尾充大;川路英哉;竹中要一;松田秀雄;橋本昭洋第23回日本分子生物学会年会講演予稿集4PA-0142000年12月
学会発表統計的スコアに基づく局所マルチプルアライメントアルゴリズム単行本共著長尾充大;山口陽介;川路英哉;竹中要一;松田秀雄;橋本昭洋第23回日本分子生物学会年会講演予稿集4PA-0152000年12月
論文A proposal of neuron filter: a constraint resolution scheme of neural networks for combinatorial optimization problems査読有学術雑誌共著Takenaka Yoichi;Funabiki Nobuo;Higashino TeruoIEICE Transactions of Fundamentals (E83-A・9 ), pp.1815-18232000年9月
国際学会A proposal of neuron filter algorithm with a thinning-out method for total coloring problems査読有単行本共著Yoichi Takenaka;Nobuo FunabikiProc. 4th world multi conference of Systemics, Cybernetics and Informatics (SCI2000)pp. 563-5682000年7月
国際学会A non-feedback neuron filter algorithm for separated board-level routing problems in FPGA-based logic emulation systems査読有単行本共著TAKENAKA Yoichi;FUNABIKI NobuoProceedings of IEEE International Joint Conference on Neural Networks (IJCNN'99)Jcnn0550.pdf1999年7月
国際学会A gradual neural network approach for broadcast scheduling in packet radio networks査読有単行本共著FUNABIKI Nobuo;TAKENAKA YoichiProceedings of IEEE International Joint Conference on Neural Networks (IJCNN'99)Jcnn0551.pdf1999年7月
論文チャネル割当問題を対象とした拡張マキシマムニューラルネットワーク解法の提案査読有学術雑誌共著池永勝芳;竹中要一;船曳信生電子情報通信学会和文論文誌A第82巻8号, pp. 683-6901999年5月
学会発表A neuron filter algorithm for board-level routing problems in FPGA-based logic emulationsystems学術雑誌共著TAKENAKA Yoichi;FUNABIKI Nobuo信学技報NLP98-87, pp. 23-291998年12月
国際学会An improved genetic algorithm using the Convex Hull for traveling salesman problem査読有単行本共著TAKENAKA Yoichi;FUNABIKI NobuoProceedings of IEEE International Conference on Systems, Man, and Cybernetics (SMC'98) pp. 2279-22841998年10月
学会発表セルラー通信網のあるチャネル割当問題に対するマキシマムニューラルネットワーク開放の提案学術雑誌共著池永勝芳;竹中要一;船曳信生;北道淳司信学技報NLP97-172, pp. 85-921998年3月
学会発表巡回セールスマン問題の遺伝的アルゴリズムに対する凸包の応用学術雑誌共著竹中要一;船曳信生信学技報SS97-48, pp.17-241998年1月
論文N-Queen問題を対象としたマキシマムニューロンモデルの競合解消方式の提案査読有学術雑誌共著竹中要一;船曳信生;西川清史情報処理学会論文誌第38巻11号,pp. 2142-21481997年11月
論文A maximum neural network approach for N-Queen problems. 査読有学術雑誌共著Funabiki Nobuo;Takenaka Yoichi;Nishikawa SeishiBiological Cybernetics(76), pp. 251-2551997年6月
国際学会A proposal of neuron mask in neural network algorithm for combinatorial optimization problems査読有単行本共著TAKENAKA Yoichi;FUNABIKI Nobuo;NISHIKAWA SeishiProceedings of IEEE International Conference on Neural Networks (ICNN'97)Vol.2, pp. 1289-1294 1997年6月
学会発表巡回セールスマン問題を対象としたニューロンフィルタの提案学術雑誌共著竹中要一;船曳信生;西川清史信学技報NC96-150, pp. 287-2941997年3月
学会発表N-Queen問題を対象としたマキシマムニューロンモデルのWinner-take-all方式に関する研究学術雑誌共著竹中要一;船曳信生;西川清史信学技報SS96-26, pp. 25-321996年11月
論文マキシマムニューロンを用いたN-Queen問題のニューラルネットワーク解法の提案査読有学術雑誌共著竹中要一;船曳信生;西川清史情報処理学会誌第37巻10号,pp. 1788-17911996年10月
学会発表マキシマムニューロンを用いたN-Queen問題の準同期並列解法の提案学術雑誌共著竹中要一;船曳信生;西川清史信学技報COMP95-81, pp. 77-841996年1月
国際学会A Method for the Inference of Gene Regulatory Networks based on Dynamic Bayesian Network with Clustering of Time-Series Subsequences査読無共著Yuya Shuto;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo MatsudaProceedings of the 20th International Conference on Genome Informatics (GIW2009)P080